More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0039 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.57 
 
 
479 aa  773  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74 
 
 
473 aa  727  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.82 
 
 
471 aa  675  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.48 
 
 
473 aa  759  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.71 
 
 
472 aa  658  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.1 
 
 
471 aa  648  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.03 
 
 
471 aa  646  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 
473 aa  979  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  79.15 
 
 
479 aa  786  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.11 
 
 
472 aa  667  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  83.47 
 
 
479 aa  798  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.02 
 
 
478 aa  641  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.5 
 
 
471 aa  638  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.67 
 
 
478 aa  635  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.18 
 
 
478 aa  635  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  68.6 
 
 
471 aa  625  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.74 
 
 
480 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.31 
 
 
480 aa  624  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  64.48 
 
 
483 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.45 
 
 
471 aa  621  1e-177  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  62.58 
 
 
476 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  64.06 
 
 
475 aa  618  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  62.79 
 
 
485 aa  615  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.81 
 
 
496 aa  613  1e-174  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
476 aa  613  1e-174  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0626  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  66.52 
 
 
481 aa  613  1e-174  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.549264  normal  0.0480596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  63.21 
 
 
475 aa  611  1e-174  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.66 
 
 
476 aa  605  1e-172  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.03 
 
 
480 aa  605  1e-172  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.47 
 
 
496 aa  602  1e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
493 aa  603  1e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.97 
 
 
491 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.5 
 
 
473 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  60.67 
 
 
478 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.43 
 
 
485 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.76 
 
 
490 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.38 
 
 
472 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.77 
 
 
474 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.51 
 
 
492 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
491 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.57 
 
 
491 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.31 
 
 
492 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.38657e-09 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.3 
 
 
485 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
472 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
472 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.26 
 
 
472 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  61.59 
 
 
495 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.47 
 
 
491 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1924  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63 
 
 
475 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09982e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.13 
 
 
498 aa  586  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
472 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.63 
 
 
472 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.28 
 
 
472 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.63 
 
 
472 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.25 
 
 
519 aa  588  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.72 
 
 
469 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.15 
 
 
472 aa  582  1e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.92 
 
 
512 aa  582  1e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  584  1e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3758  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.71 
 
 
473 aa  582  1e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.63 
 
 
476 aa  581  1e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  583  1e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.66 
 
 
467 aa  582  1e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.93 
 
 
473 aa  583  1e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.48 
 
 
476 aa  582  1e-165  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.85 
 
 
473 aa  584  1e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.2 
 
 
477 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.42 
 
 
495 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.8 
 
 
472 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.2 
 
 
477 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.94 
 
 
477 aa  577  1e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 
479 aa  577  1e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.58 
 
 
465 aa  577  1e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.38 
 
 
474 aa  575  1e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1604  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
468 aa  577  1e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.93 
 
 
464 aa  577  1e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0146  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.28 
 
 
476 aa  578  1e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.36 
 
 
465 aa  575  1e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.18 
 
 
476 aa  576  1e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.37 
 
 
472 aa  575  1e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.1 
 
 
471 aa  577  1e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.15 
 
 
476 aa  576  1e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  7.92408e-15  hitchhiker  2.66691e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5698  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.23 
 
 
473 aa  572  1e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.457969  normal  0.268273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0931  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.58 
 
 
468 aa  572  1e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.07 
 
 
469 aa  571  1e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.792658  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  61.59 
 
 
481 aa  573  1e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4897  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.15 
 
 
468 aa  574  1e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0741  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.93 
 
 
466 aa  572  1e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.38 
 
 
474 aa  574  1e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4433  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.15 
 
 
468 aa  574  1e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.513976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.36 
 
 
465 aa  573  1e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.56 
 
 
465 aa  572  1e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1589  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.67 
 
 
471 aa  572  1e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  58.4 
 
 
498 aa  572  1e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.38 
 
 
474 aa  573  1e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>