18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0035 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  43.61 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  38.89 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  38.03 
 
 		 148 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  32.84 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  34.97 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  31.65 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  35.07 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  33.57 
 
 		 327 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  30.83 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  29.85 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  30.28 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  35 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  29.13 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  33.98 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  29.5 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  34.23 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  34.58 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>