18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0035 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 
154 aa  311  2e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  43.61 
 
 
152 aa  114  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  38.89 
 
 
148 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  38.03 
 
 
148 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  32.84 
 
 
146 aa  78.6  3e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  34.97 
 
 
156 aa  77  8e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  31.65 
 
 
146 aa  75.5  3e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  35.07 
 
 
143 aa  74.7  5e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.01878e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  33.57 
 
 
327 aa  68.2  4e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  30.83 
 
 
148 aa  65.5  3e-10  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  1.04538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  29.85 
 
 
148 aa  65.1  4e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  5.53397e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  30.28 
 
 
172 aa  64.3  6e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  35 
 
 
156 aa  63.5  1e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  29.13 
 
 
148 aa  62  3e-09  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  6.30666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  33.98 
 
 
171 aa  54.3  6e-07  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  29.5 
 
 
182 aa  54.3  6e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  34.23 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  34.58 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>