169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0033 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  100 
 
 
224 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  54.71 
 
 
224 aa  244  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  52.47 
 
 
224 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  49.78 
 
 
224 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  50.97 
 
 
216 aa  194  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0980  hypothetical protein  48.31 
 
 
219 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0950  hypothetical protein  48.31 
 
 
219 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  44 
 
 
227 aa  173  2e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0766  peptidase M50  44.95 
 
 
213 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.209931  normal  0.716111 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1685  peptidase M50  46.43 
 
 
219 aa  163  2e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.800401  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1788  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.86 
 
 
219 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1465  peptidase M50  46.86 
 
 
219 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.658602  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  50.52 
 
 
205 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  46.15 
 
 
224 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  46.2 
 
 
222 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.42117e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1036  peptidase M50  41.67 
 
 
223 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.375981  normal  0.481389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3710  peptidase M50  42.45 
 
 
222 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204012  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0751  peptidase M50  43.96 
 
 
203 aa  151  8e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3239  peptidase M50  40.19 
 
 
222 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1937  peptidase, M50 family protein  41.97 
 
 
230 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.0669e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1565  peptidase M50  44.39 
 
 
202 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4024  peptidase M50  41.67 
 
 
223 aa  145  7e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0256  membrane endopeptidase, M50 family  41.97 
 
 
230 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3277  peptidase M50  39.72 
 
 
222 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181105  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  42.45 
 
 
226 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  6.94823e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2485  peptidase M50  44.5 
 
 
235 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.904327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3427  peptidase M50  44.83 
 
 
214 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1430  peptidase M50  42.92 
 
 
220 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3859  peptidase M50  43.78 
 
 
214 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1903  M50 family peptidase  42.47 
 
 
221 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  44.85 
 
 
225 aa  142  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.48344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  41.58 
 
 
218 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5414  peptidase M50  40.89 
 
 
260 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1037  peptidase M50  47.44 
 
 
233 aa  141  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.489327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  41.18 
 
 
223 aa  140  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2568  M50 family peptidase  43.13 
 
 
221 aa  140  2e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  45.08 
 
 
209 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3134  M50 family peptidase  43.13 
 
 
221 aa  139  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2622  M50 family peptidase  43.13 
 
 
221 aa  139  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1456  M50 family peptidase  43.13 
 
 
221 aa  139  4e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.848737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2183  M50 family peptidase  43.13 
 
 
221 aa  139  4e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1681  M50 family peptidase  43.13 
 
 
221 aa  139  4e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1176  peptidase M50  42.01 
 
 
220 aa  139  4e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  2.67002e-06 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2008  peptidase M50  42.79 
 
 
220 aa  138  5e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672002  hitchhiker  7.25285e-05 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0386  peptidase M50  40.83 
 
 
220 aa  138  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0579866  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2135  peptidase M50  42.79 
 
 
220 aa  138  8e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  43.1 
 
 
225 aa  138  9e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1961  peptidase M50  41.4 
 
 
226 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.52923e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  40.5 
 
 
221 aa  136  3e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1298  Zn-dependent proteases  42.13 
 
 
247 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2551  peptidase M50  41.51 
 
 
220 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00369558  normal  0.148044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1582  peptidase M50  41.51 
 
 
220 aa  135  6e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453611  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07160  peptidase M50  39.11 
 
 
218 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.43376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1002  peptidase M50  38.76 
 
 
222 aa  134  1e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693021  hitchhiker  0.000264691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2756  peptidase M50  41.15 
 
 
232 aa  134  1e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.85404e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  40.5 
 
 
221 aa  133  2e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1526  putative integral membrane transmembrane protein  45.02 
 
 
234 aa  134  2e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0750535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5404  peptidase M50  42.35 
 
 
220 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.535457  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  40.41 
 
 
228 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  40.41 
 
 
228 aa  132  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1776  peptidase M50  44.2 
 
 
228 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00724949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0681  peptidase M50  43.14 
 
 
221 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.259408  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1924  peptidase M50  42.38 
 
 
226 aa  132  4e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1834  M50 family peptidase  42.31 
 
 
226 aa  132  4e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2098  peptidase M50  42.35 
 
 
220 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2116  peptidase M50  42.35 
 
 
220 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5979  peptidase M50  42.35 
 
 
220 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1686  peptidase M50  42.65 
 
 
225 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2316  peptidase M50  43.48 
 
 
216 aa  131  1e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1875  peptidase M50  42.16 
 
 
213 aa  130  1e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1339  peptidase M50  41.26 
 
 
220 aa  129  2e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4793e-08 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2299  peptidase M50  40.19 
 
 
226 aa  130  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0475  peptidase M50  38.99 
 
 
239 aa  130  2e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  44.66 
 
 
207 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  39.22 
 
 
221 aa  127  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2460  peptidase M50  44.5 
 
 
217 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754633  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1470  peptidase M50  41.36 
 
 
200 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1419  peptidase M50  43.63 
 
 
207 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0643259  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0720  peptidase M50  36.17 
 
 
226 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.089532  normal  0.0115297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1225  peptidase M50  40.44 
 
 
226 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.460426  normal  0.363921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1653  peptidase M50  39.51 
 
 
220 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.580306 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1624  peptidase M50  42.72 
 
 
225 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0374548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  38.03 
 
 
221 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  46.84 
 
 
198 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0952  peptidase M50  39.58 
 
 
231 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  37.5 
 
 
224 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  37.5 
 
 
224 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  36.5 
 
 
224 aa  120  1e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1142  integral membrane transmembrane protein  38.89 
 
 
225 aa  120  2e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  35.64 
 
 
224 aa  120  2e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  35.64 
 
 
224 aa  120  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  36.5 
 
 
224 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  36.5 
 
 
224 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  36.5 
 
 
224 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06780  Zn-dependent protease  41.67 
 
 
228 aa  120  2e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0109989  normal  0.843659 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09610  Zn-dependent protease  42.11 
 
 
224 aa  120  2e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000371518  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0791  peptidase M50  41.24 
 
 
211 aa  120  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.34184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  36.5 
 
 
224 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2259  peptidase M50  38.74 
 
 
214 aa  119  4e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3219  peptidase M50  40.72 
 
 
223 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>