More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0030 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
349 aa  714  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  60.12 
 
 
440 aa  407  1e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  61.42 
 
 
620 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  48.78 
 
 
389 aa  325  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  45.05 
 
 
336 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  43.55 
 
 
339 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 
357 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.46 
 
 
338 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  38.35 
 
 
332 aa  201  2e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  40.33 
 
 
356 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 
344 aa  198  1e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 
334 aa  198  1e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.18 
 
 
345 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.73 
 
 
333 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 
331 aa  190  3e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 
345 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  38.85 
 
 
332 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  39.86 
 
 
377 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 
358 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 
329 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 
376 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  39.09 
 
 
336 aa  183  5e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  37.92 
 
 
315 aa  182  8e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  40.63 
 
 
337 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 
362 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  38.1 
 
 
340 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  38.55 
 
 
339 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  34.67 
 
 
338 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 
442 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  34.88 
 
 
338 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  34.51 
 
 
341 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 
335 aa  176  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 
328 aa  174  2e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  36 
 
 
352 aa  174  2e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  41.81 
 
 
343 aa  174  3e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  35.94 
 
 
327 aa  174  3e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96609e-10 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 
333 aa  173  4e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  34.28 
 
 
356 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  35.42 
 
 
357 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 
355 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  41.81 
 
 
343 aa  172  6e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 
332 aa  172  8e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 
362 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  37.26 
 
 
349 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  35.34 
 
 
336 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  38.48 
 
 
320 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 
335 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 
327 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  9.92333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  41.14 
 
 
343 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  34.09 
 
 
346 aa  170  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.1 
 
 
343 aa  169  8e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.33 
 
 
333 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  37.86 
 
 
325 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  35.63 
 
 
331 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  35.54 
 
 
349 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  35.24 
 
 
349 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  37.77 
 
 
328 aa  166  7e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 
335 aa  166  7e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 
337 aa  166  7e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  166  8e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  32.61 
 
 
351 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  35.43 
 
 
399 aa  165  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  32.87 
 
 
338 aa  165  1e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  37.2 
 
 
350 aa  164  2e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
336 aa  164  2e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 
364 aa  164  2e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  39.93 
 
 
334 aa  164  2e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  36.71 
 
 
412 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
341 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.55777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  36.71 
 
 
438 aa  162  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 
456 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  34.76 
 
 
337 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  33.05 
 
 
348 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 
331 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 
357 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 
344 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  33.44 
 
 
340 aa  160  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 
340 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
323 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  35.6 
 
 
337 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 
341 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  9.53369e-09  decreased coverage  7.38863e-07 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  36.01 
 
 
339 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  36.81 
 
 
340 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  36.81 
 
 
340 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  3.63112e-14 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  36.81 
 
 
340 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.0184e-13 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 
339 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  36.81 
 
 
340 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  1.01215e-15 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  34.57 
 
 
371 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  37.13 
 
 
340 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  35.41 
 
 
403 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  34.59 
 
 
358 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 
387 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  33.84 
 
 
393 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  33.43 
 
 
379 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  35.82 
 
 
331 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  37.86 
 
 
339 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 
335 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  34.72 
 
 
339 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  37.3 
 
 
339 aa  156  5e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  28.7 
 
 
333 aa  156  5e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>