More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0024 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0024  peptidase U32  100 
 
 
754 aa  1533  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0074  peptidase U32  61.18 
 
 
697 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2141  peptidase U32  56.37 
 
 
709 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0058  U32 family peptidase  54.2 
 
 
748 aa  508  1e-142  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0327  peptidase U32  44.84 
 
 
656 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3248  peptidase U32  43.37 
 
 
654 aa  350  7e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1030  peptidase U32  40.93 
 
 
656 aa  337  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  46.63 
 
 
822 aa  185  2e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  44.5 
 
 
792 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  44.5 
 
 
790 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  45.15 
 
 
746 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  42.22 
 
 
792 aa  176  1e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  46.8 
 
 
696 aa  175  3e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  43.63 
 
 
886 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  45.19 
 
 
790 aa  172  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  44.23 
 
 
790 aa  168  3e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  42.65 
 
 
818 aa  168  3e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  42.5 
 
 
872 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  45.27 
 
 
862 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.90003e-07  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  43.35 
 
 
810 aa  159  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  42.23 
 
 
790 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  44.05 
 
 
848 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  45.71 
 
 
838 aa  154  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  44.5 
 
 
835 aa  154  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  41.58 
 
 
767 aa  154  6e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  42.57 
 
 
836 aa  154  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  39.27 
 
 
783 aa  153  9e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  39.27 
 
 
783 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  42.08 
 
 
783 aa  153  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  38.46 
 
 
548 aa  153  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  40.59 
 
 
839 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  42.16 
 
 
805 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  43.35 
 
 
835 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  39.3 
 
 
783 aa  151  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  41.58 
 
 
847 aa  149  1e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  40.8 
 
 
411 aa  148  4e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  39.3 
 
 
411 aa  148  4e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  40 
 
 
828 aa  148  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  39.6 
 
 
817 aa  148  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2495  peptidase U32  38.28 
 
 
413 aa  147  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  43.5 
 
 
825 aa  147  6e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  40 
 
 
723 aa  147  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  38.35 
 
 
422 aa  147  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  40.3 
 
 
746 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  38.31 
 
 
408 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  42.86 
 
 
877 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  37.68 
 
 
826 aa  145  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  41.46 
 
 
837 aa  144  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  44 
 
 
840 aa  143  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  41.75 
 
 
835 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  37.62 
 
 
420 aa  143  1e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  46.27 
 
 
805 aa  142  2e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  41.38 
 
 
841 aa  142  2e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  31.61 
 
 
462 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  43.2 
 
 
839 aa  141  4e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  37.9 
 
 
826 aa  140  9e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1925  peptidase U32  37.98 
 
 
414 aa  140  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.984732  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2093  peptidase U32  38.61 
 
 
413 aa  140  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  42.44 
 
 
852 aa  139  3e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  38.12 
 
 
406 aa  139  3e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1685  peptidase U32  38 
 
 
403 aa  139  3e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  35.62 
 
 
471 aa  137  6e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  38.12 
 
 
420 aa  137  6e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  37.75 
 
 
722 aa  137  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  40.09 
 
 
823 aa  137  1e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  40.59 
 
 
406 aa  136  1e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  37.13 
 
 
439 aa  136  1e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  31.45 
 
 
458 aa  136  2e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  31.45 
 
 
458 aa  136  2e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  42.72 
 
 
835 aa  134  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  40.3 
 
 
878 aa  134  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  39.9 
 
 
851 aa  133  1e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  34.65 
 
 
426 aa  133  1e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  37.5 
 
 
716 aa  133  1e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0228  peptidase U32  37.5 
 
 
403 aa  132  2e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  40.53 
 
 
873 aa  132  2e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  38.92 
 
 
430 aa  132  2e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.93466e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  30.59 
 
 
423 aa  132  2e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1711  peptidase U32  37.81 
 
 
433 aa  132  2e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  39.32 
 
 
748 aa  132  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0294  collagenase  36.71 
 
 
420 aa  132  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0916  peptidase U32  37.5 
 
 
403 aa  132  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.672629  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  40 
 
 
418 aa  131  5e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2127  peptidase U32  38.54 
 
 
415 aa  131  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00706152 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  42.79 
 
 
663 aa  130  8e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1532  peptidase U32  37.13 
 
 
403 aa  130  8e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.207316  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  38.92 
 
 
747 aa  129  1e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  39.22 
 
 
757 aa  130  1e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67027e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  37.31 
 
 
409 aa  129  2e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1022  peptidase U32  29.86 
 
 
471 aa  129  2e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  30.86 
 
 
453 aa  129  2e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  36.63 
 
 
407 aa  129  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  43.38 
 
 
834 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  37.31 
 
 
409 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  40.8 
 
 
833 aa  129  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  42.79 
 
 
663 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  36.8 
 
 
435 aa  128  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  35.71 
 
 
411 aa  127  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  37.25 
 
 
404 aa  127  8e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  27.34 
 
 
471 aa  127  8e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>