281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0019 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
276 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  5.75449e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  54.89 
 
 
288 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  53.48 
 
 
267 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  46.88 
 
 
270 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
263 aa  112  1e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  30.04 
 
 
273 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 
335 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
276 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 
349 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.89 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 
354 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  25.91 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  35.53 
 
 
876 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.29 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
664 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
671 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
671 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 
248 aa  84.7  2e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  32.72 
 
 
671 aa  84  3e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 
260 aa  83.6  3e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 
306 aa  83.2  4e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 
257 aa  83.6  4e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
260 aa  82.4  7e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
238 aa  80.1  4e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 
173 aa  79.3  6e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
230 aa  79.3  6e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 
257 aa  79  8e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  30.91 
 
 
261 aa  78.6  9e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  30.91 
 
 
261 aa  78.6  9e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  27.75 
 
 
616 aa  78.6  1e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
228 aa  78.2  1e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  30.72 
 
 
600 aa  78.2  1e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
265 aa  77.4  2e-13  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 
217 aa  77.4  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  24 
 
 
390 aa  77.4  3e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
275 aa  76.6  4e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  33.92 
 
 
209 aa  76.6  4e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 
211 aa  76.3  5e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 
211 aa  76.3  6e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 
240 aa  76.3  6e-13  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
281 aa  75.9  7e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 
263 aa  75.9  7e-13  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  28.77 
 
 
252 aa  75.5  8e-13  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  28.77 
 
 
252 aa  75.5  8e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 
313 aa  75.5  9e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
173 aa  75.1  1e-12  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  1.4473e-10 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 
214 aa  75.1  1e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 
222 aa  73.9  3e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
211 aa  73.9  3e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  26.03 
 
 
255 aa  73.2  4e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 
263 aa  72.8  5e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 
268 aa  72.8  5e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  31.9 
 
 
222 aa  72.8  6e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
255 aa  72.8  6e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  26.02 
 
 
259 aa  72.4  7e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
255 aa  72.4  8e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  28.97 
 
 
209 aa  70.9  2e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.64 
 
 
262 aa  70.9  2e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  33.75 
 
 
233 aa  71.2  2e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  30.92 
 
 
624 aa  70.9  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
236 aa  70.5  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
221 aa  70.1  3e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  26.71 
 
 
265 aa  70.1  4e-11  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
259 aa  69.7  4e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 
276 aa  69.7  5e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  25.66 
 
 
630 aa  69.7  5e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 
281 aa  69.7  5e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
205 aa  69.7  5e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
247 aa  69.3  6e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
259 aa  69.3  6e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
265 aa  69.3  6e-11  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  28.77 
 
 
274 aa  68.9  8e-11  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
210 aa  68.9  9e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 
182 aa  68.9  9e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 
188 aa  68.6  1e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 
255 aa  68.6  1e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 
242 aa  68.6  1e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  33.12 
 
 
213 aa  68.2  1e-10  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 
255 aa  68.2  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 
254 aa  68.6  1e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 
255 aa  68.6  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 
236 aa  68.2  1e-10  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  28.66 
 
 
254 aa  67.8  2e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  32.75 
 
 
217 aa  67.8  2e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.59275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  24.15 
 
 
243 aa  67.8  2e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  24.15 
 
 
243 aa  67.8  2e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  24.91 
 
 
265 aa  67.4  2e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
210 aa  67.8  2e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  24.91 
 
 
265 aa  67.4  2e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  32.75 
 
 
219 aa  67.8  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.75 
 
 
219 aa  67.8  2e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.30709e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  31.55 
 
 
198 aa  68.2  2e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
293 aa  67  3e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  32.75 
 
 
216 aa  67  3e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 
252 aa  67  3e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  32.75 
 
 
217 aa  67  3e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.89982e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>