More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0015 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  100 
 
 
304 aa  601  1e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  54.52 
 
 
310 aa  306  4e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  53.63 
 
 
304 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  47.08 
 
 
305 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  43.27 
 
 
314 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  45.17 
 
 
294 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  43.39 
 
 
281 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  42.31 
 
 
295 aa  225  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  45.15 
 
 
274 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  42.76 
 
 
301 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  45.64 
 
 
296 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  41.28 
 
 
272 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  43.19 
 
 
284 aa  216  3e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.09761e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  40.55 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  40.89 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  40.89 
 
 
283 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  3.9914e-05 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  39.32 
 
 
283 aa  216  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.28 
 
 
286 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  40.21 
 
 
283 aa  215  6e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16094e-10 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  40.21 
 
 
283 aa  215  6e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  40.21 
 
 
283 aa  215  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  40.89 
 
 
283 aa  215  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  45.63 
 
 
307 aa  213  3e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  41.83 
 
 
289 aa  212  7e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  39.86 
 
 
283 aa  212  8e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.05 
 
 
289 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  42.95 
 
 
272 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  40.48 
 
 
286 aa  210  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.97 
 
 
290 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  42.32 
 
 
286 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.43085e-05  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.7 
 
 
289 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  40.27 
 
 
283 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  44.44 
 
 
309 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  40.74 
 
 
285 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.38 
 
 
290 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  44.69 
 
 
326 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  42.37 
 
 
284 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.38 
 
 
290 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  41.58 
 
 
290 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  45.24 
 
 
292 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.15 
 
 
279 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  41.38 
 
 
294 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  41.53 
 
 
286 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  4.01981e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.15 
 
 
279 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  38.13 
 
 
293 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  40.71 
 
 
295 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7092  parB-like partition protein  41.79 
 
 
331 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.72 
 
 
290 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  42.72 
 
 
296 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  42.21 
 
 
299 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  42.72 
 
 
301 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  40.26 
 
 
312 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  40.4 
 
 
280 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  41.06 
 
 
256 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  38.82 
 
 
323 aa  201  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.58 
 
 
294 aa  201  1e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.58 
 
 
304 aa  201  1e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  37.67 
 
 
295 aa  201  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  41.36 
 
 
288 aa  200  2e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  39.8 
 
 
283 aa  201  2e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.94343e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  45.93 
 
 
281 aa  200  2e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  41.72 
 
 
290 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  42.38 
 
 
290 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  41 
 
 
286 aa  199  4e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  41.36 
 
 
278 aa  199  4e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.97018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  39.32 
 
 
283 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  41.39 
 
 
300 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  41.69 
 
 
297 aa  198  8e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  42.86 
 
 
279 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  41.16 
 
 
294 aa  198  1e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  40.39 
 
 
294 aa  198  1e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  2.28393e-09 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  38.54 
 
 
321 aa  198  1e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  38.89 
 
 
289 aa  197  1e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  40.68 
 
 
256 aa  198  1e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.67 
 
 
305 aa  197  2e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  40.67 
 
 
297 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  39.47 
 
 
298 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.33 
 
 
305 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  42.18 
 
 
288 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  40.67 
 
 
297 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  39.32 
 
 
293 aa  196  4e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  40.48 
 
 
294 aa  196  4e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  39.8 
 
 
285 aa  196  4e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  36.61 
 
 
281 aa  196  4e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  40.54 
 
 
292 aa  196  4e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  45.22 
 
 
298 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  41.81 
 
 
297 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  40.73 
 
 
290 aa  195  8e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  40.88 
 
 
315 aa  195  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  40.73 
 
 
288 aa  195  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.89 
 
 
282 aa  195  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  43.06 
 
 
295 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  41.08 
 
 
295 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  36.69 
 
 
299 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  39.14 
 
 
296 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  41.67 
 
 
309 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  37.74 
 
 
307 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  39.33 
 
 
268 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  37.39 
 
 
328 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  41.5 
 
 
294 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>