40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0013 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  100 
 
 
291 aa  582  1e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  55.3 
 
 
354 aa  285  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  52.94 
 
 
307 aa  282  6e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  51.15 
 
 
268 aa  244  2e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  50.94 
 
 
298 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  41.79 
 
 
269 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  41 
 
 
267 aa  201  2e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  41.11 
 
 
255 aa  198  8e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  39.68 
 
 
259 aa  197  2e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  39.59 
 
 
251 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  43.6 
 
 
262 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  39.92 
 
 
256 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  37.23 
 
 
259 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  41.83 
 
 
256 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  184  1e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  40.16 
 
 
269 aa  184  2e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  34.94 
 
 
250 aa  179  5e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  38.58 
 
 
258 aa  178  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  38.71 
 
 
250 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  39.8 
 
 
251 aa  158  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  42.77 
 
 
275 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  45.2 
 
 
193 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  38.51 
 
 
251 aa  140  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.09757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0016  hypothetical protein  78.87 
 
 
95 aa  120  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  28.25 
 
 
237 aa  77.4  3e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  27.22 
 
 
234 aa  75.5  1e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  26.29 
 
 
232 aa  73.6  4e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  28.28 
 
 
230 aa  73.2  5e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  29.51 
 
 
214 aa  72.4  9e-12  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  28.68 
 
 
214 aa  72  1e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  24.32 
 
 
245 aa  72  1e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  27.34 
 
 
214 aa  71.6  1e-11  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  69.7  6e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  28.8 
 
 
211 aa  67.8  2e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  22.62 
 
 
208 aa  60.8  2e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  29.23 
 
 
223 aa  60.8  2e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  27 
 
 
177 aa  58.5  1e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  23.57 
 
 
211 aa  55.1  1e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  25 
 
 
206 aa  53.5  4e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  28.93 
 
 
634 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>