More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0008 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  67.99 
 
 
467 aa  649  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
467 aa  969  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  67.1 
 
 
462 aa  652  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  62.42 
 
 
462 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  61.12 
 
 
461 aa  586  1e-166  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  60.17 
 
 
463 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  55.92 
 
 
487 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
466 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
474 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
477 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  53.78 
 
 
467 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
477 aa  493  1e-138  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  55 
 
 
467 aa  494  1e-138  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
475 aa  492  1e-138  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  51.66 
 
 
468 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
466 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
474 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  53.16 
 
 
484 aa  470  1e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
485 aa  466  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
488 aa  467  1e-130  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  51.51 
 
 
465 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  52.16 
 
 
485 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  52.16 
 
 
485 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
487 aa  459  1e-128  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  452  1e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
482 aa  452  1e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  453  1e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
470 aa  452  1e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  452  1e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  453  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
470 aa  452  1e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  453  1e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  453  1e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  453  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
471 aa  453  1e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
474 aa  452  1e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
475 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
481 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
480 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
471 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
471 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
471 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 
495 aa  447  1e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
492 aa  447  1e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
469 aa  447  1e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  48.49 
 
 
474 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
488 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
476 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
511 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
491 aa  441  1e-122  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
500 aa  441  1e-122  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  50.67 
 
 
472 aa  441  1e-122  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
499 aa  440  1e-122  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
491 aa  441  1e-122  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
465 aa  440  1e-122  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  46.64 
 
 
478 aa  441  1e-122  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
494 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  47.58 
 
 
475 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0396  amidophosphoribosyltransferase  46.49 
 
 
459 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
494 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
506 aa  433  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  47.72 
 
 
514 aa  435  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
500 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  49.15 
 
 
503 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
496 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 
499 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
491 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  46.87 
 
 
503 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
472 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  45.47 
 
 
459 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1523  amidophosphoribosyltransferase  46.17 
 
 
459 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0119394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  48.23 
 
 
480 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
491 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
463 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
473 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  47.48 
 
 
479 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
493 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  47.71 
 
 
503 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
514 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
462 aa  426  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
472 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  45.47 
 
 
456 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
459 aa  425  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  45.63 
 
 
478 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
501 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  48.16 
 
 
493 aa  422  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  46.32 
 
 
477 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  48.34 
 
 
502 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
506 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
509 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
482 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  47.18 
 
 
445 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  46.14 
 
 
534 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
472 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  47.26 
 
 
496 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
480 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
491 aa  417  1e-115  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
517 aa  418  1e-115  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
510 aa  417  1e-115  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
493 aa  418  1e-115  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>