More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0002 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  100 
 
 
523 aa  1066  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  53.87 
 
 
417 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  52.88 
 
 
441 aa  408  1e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  49.31 
 
 
439 aa  354  3e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  42.57 
 
 
465 aa  340  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.91 
 
 
441 aa  310  3e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  44.35 
 
 
470 aa  303  4e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  37.06 
 
 
517 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  2.97595e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  38.37 
 
 
437 aa  249  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  37.57 
 
 
475 aa  245  2e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  1.03245e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  45.1 
 
 
741 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.24744e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.09 
 
 
475 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.04 
 
 
470 aa  235  2e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  36.02 
 
 
473 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  4.94323e-08  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.88 
 
 
472 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  2.82967e-07  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  37.04 
 
 
503 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.86305e-11  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  35.88 
 
 
474 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.88 
 
 
473 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.88 
 
 
475 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.99 
 
 
447 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.56584e-05  decreased coverage  1.18926e-09 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  42.41 
 
 
448 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.36446e-08  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  40.57 
 
 
430 aa  223  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  44.09 
 
 
468 aa  222  1e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  35.33 
 
 
513 aa  222  1e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33 
 
 
490 aa  221  2e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  41.7 
 
 
480 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  37.11 
 
 
503 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  38.18 
 
 
440 aa  219  8e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  38.18 
 
 
440 aa  219  8e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  40.12 
 
 
457 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.88 
 
 
437 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  38.87 
 
 
435 aa  217  3e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  36.63 
 
 
479 aa  217  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  37.17 
 
 
429 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  40.07 
 
 
438 aa  215  1e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  35.03 
 
 
470 aa  214  3e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  43.17 
 
 
460 aa  214  4e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  36.39 
 
 
498 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  34.68 
 
 
490 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  40.08 
 
 
459 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.84 
 
 
439 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  33.85 
 
 
462 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  39.69 
 
 
477 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  33.85 
 
 
429 aa  205  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  1.76405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  37.24 
 
 
441 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.96 
 
 
569 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  38.91 
 
 
477 aa  202  2e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  44.36 
 
 
464 aa  201  2e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  40.99 
 
 
462 aa  202  2e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  31.41 
 
 
491 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.101e-05  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  29.15 
 
 
466 aa  200  4e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.44164e-07  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  37.38 
 
 
472 aa  200  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  29.07 
 
 
468 aa  199  1e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  33.8 
 
 
491 aa  198  2e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  39.58 
 
 
446 aa  198  2e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  41.47 
 
 
385 aa  198  2e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  38.17 
 
 
465 aa  198  2e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  33.92 
 
 
406 aa  198  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  41.4 
 
 
465 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  34.68 
 
 
417 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  28.42 
 
 
466 aa  197  5e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.32238e-08  hitchhiker  7.91404e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  41.26 
 
 
464 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  33.77 
 
 
460 aa  196  8e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  32.1 
 
 
482 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  31.27 
 
 
475 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  28.06 
 
 
468 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  35.35 
 
 
434 aa  192  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.11 
 
 
472 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  28.06 
 
 
468 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  36.36 
 
 
436 aa  192  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  28.06 
 
 
468 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  40.07 
 
 
457 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.38 
 
 
533 aa  191  3e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  28.06 
 
 
468 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  34.71 
 
 
457 aa  190  6e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  40.08 
 
 
380 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  33.11 
 
 
512 aa  188  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  39.46 
 
 
460 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  39.06 
 
 
471 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  41.28 
 
 
453 aa  186  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.51 
 
 
386 aa  186  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  31.68 
 
 
490 aa  185  1e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.67 
 
 
471 aa  185  1e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42.11 
 
 
386 aa  186  1e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  36.96 
 
 
389 aa  184  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  40.5 
 
 
353 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.85495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  42.51 
 
 
386 aa  184  4e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  38.52 
 
 
390 aa  184  4e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  38.58 
 
 
429 aa  184  4e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  32.35 
 
 
441 aa  184  4e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  32.64 
 
 
692 aa  183  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  41.07 
 
 
665 aa  182  9e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  32.9 
 
 
475 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  37.38 
 
 
453 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  40.87 
 
 
690 aa  181  3e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  34.6 
 
 
433 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.24474e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  38.1 
 
 
695 aa  180  6e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 
353 aa  180  7e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  33.7 
 
 
449 aa  180  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  40.07 
 
 
454 aa  179  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>