More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3776 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 		 483 aa  953    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  58.41 
 
 		 444 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.68 
 
 		 450 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  59.44 
 
 		 525 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  49.76 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.04 
 
 		 466 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  40 
 
 		 478 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.3 
 
 		 476 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  38.68 
 
 		 459 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  35.38 
 
 		 464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  42.28 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.46 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.28 
 
 		 474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  39.37 
 
 		 452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.13 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.34 
 
 		 476 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.34 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  34.57 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  33.83 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  37.1 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.78 
 
 		 459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  36.67 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.14 
 
 		 384 aa  243  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  33.12 
 
 		 476 aa  243  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  39.09 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  35.65 
 
 		 458 aa  242  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  35.01 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.49 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  34.41 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  34.94 
 
 		 473 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  36.9 
 
 		 469 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  36.29 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  37.39 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.48 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  35.78 
 
 		 465 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  37.75 
 
 		 462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  36.3 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.92 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  36.68 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  37.13 
 
 		 476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  37.83 
 
 		 382 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  35.65 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  34.09 
 
 		 475 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  37.17 
 
 		 458 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  35.6 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  44.35 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.77 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  35.16 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.54 
 
 		 396 aa  230  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  38.73 
 
 		 464 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  34.03 
 
 		 476 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  38 
 
 		 485 aa  229  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  38.13 
 
 		 488 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  35.32 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  37.4 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  37.92 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.02 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  38.07 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  38.04 
 
 		 487 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 386 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  35.5 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  35.43 
 
 		 477 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  34.59 
 
 		 492 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  40.67 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  34.94 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35.54 
 
 		 478 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  36.19 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  34.1 
 
 		 464 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  38.55 
 
 		 481 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  38.62 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  36.04 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  39.36 
 
 		 481 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  42.27 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  40.38 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  36.08 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.28 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  36.9 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  36.34 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  39.65 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.44 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  36.08 
 
 		 474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  35.83 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  36.56 
 
 		 449 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  34.84 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  40.9 
 
 		 420 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.02 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  36.2 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  40.17 
 
 		 451 aa  219  7e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  37.83 
 
 		 453 aa  219  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  37.09 
 
 		 473 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.28 
 
 		 502 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  42.95 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  36.34 
 
 		 492 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  36.34 
 
 		 492 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  38.4 
 
 		 415 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.01 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  37.53 
 
 		 476 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  39.88 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  31.03 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>