246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3701 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3701  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 
197 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1888  DNA-3-methyladenine glycosylase I  65.45 
 
 
200 aa  267  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0358  DNA-3-methyladenine glycosylase I  66.12 
 
 
191 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.1 
 
 
194 aa  254  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.03 
 
 
202 aa  247  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  61.98 
 
 
198 aa  244  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4105  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.11 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.8 
 
 
198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3581  DNA-3-methyladenine glycosylase I  63.89 
 
 
191 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.37 
 
 
193 aa  241  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0050  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 
190 aa  239  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.184428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.96 
 
 
191 aa  237  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0057  methyladenine glycosylase  56.38 
 
 
196 aa  237  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0570  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
183 aa  235  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.890211 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1473  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.32 
 
 
190 aa  232  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0794  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.81 
 
 
186 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.3 
 
 
196 aa  229  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.37 
 
 
186 aa  228  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2291  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
186 aa  227  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1176  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.48 
 
 
207 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.734996  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.22 
 
 
186 aa  225  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0491  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.83 
 
 
202 aa  224  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0672  hypothetical protein  54.7 
 
 
190 aa  223  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0656  hypothetical protein  54.7 
 
 
190 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  53.8 
 
 
189 aa  219  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.1 
 
 
191 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4683  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.12 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.85 
 
 
194 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2862  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.45 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.45 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.45 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0088  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.68 
 
 
202 aa  217  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.838117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3948  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.68 
 
 
202 aa  217  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3867  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.68 
 
 
202 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0211  DNA-3-methyladenine glycosylase  52.54 
 
 
210 aa  217  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0493  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.92 
 
 
204 aa  216  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000244091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1686  DNA-3-methyladenine glycosylase  48.92 
 
 
212 aa  216  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00244866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.14 
 
 
196 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2871  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.15 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3446  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.15 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.183324  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1673  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.15 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3104  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.15 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1933  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.63 
 
 
193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0678  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.1 
 
 
189 aa  214  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000050702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.38 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.951839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.84 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3193  DNA-3-methyladenine glycosidase I  56.15 
 
 
202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.66 
 
 
198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1277  DNA-3-methyladenine glycosidase I  54.05 
 
 
193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2725  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.35 
 
 
187 aa  210  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.3 
 
 
201 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.3 
 
 
201 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.59 
 
 
218 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 
198 aa  208  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.04 
 
 
208 aa  207  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  54.84 
 
 
189 aa  207  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.87 
 
 
217 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0983  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  51.1 
 
 
192 aa  205  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2628  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.64 
 
 
167 aa  205  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3559  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 
187 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.81 
 
 
208 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.19 
 
 
214 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3828  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.87 
 
 
198 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874293  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.31 
 
 
221 aa  202  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
217 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.45 
 
 
199 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.83 
 
 
208 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0106  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.34 
 
 
198 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119209  normal  0.580749 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.21 
 
 
192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2985  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.74 
 
 
198 aa  197  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233863 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0666  DNA-3-methyladenine glycosylase I protein  53.93 
 
 
190 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0272  50S ribosomal protein L24 (BL23; 12 kDa DNA-binding protein; HPB12)  48.59 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4680  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.89 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.651754  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2024  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.21 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488047  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23730  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.12 
 
 
183 aa  194  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00337474  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1991  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.44 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0957402  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2351  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.45 
 
 
194 aa  194  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 
208 aa  194  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0016  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.46 
 
 
196 aa  194  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl277  DNA-3-methyladenine glycosidase  46.02 
 
 
187 aa  193  1e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000678325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0857  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.31 
 
 
198 aa  193  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.671236  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3477  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
188 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.112409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4549  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.33 
 
 
188 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0064  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.84 
 
 
187 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3964  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.33 
 
 
193 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.58086  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
190 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0010  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
191 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.37 
 
 
204 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3837  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  48.33 
 
 
193 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.363143  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.37 
 
 
200 aa  190  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000164435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.81 
 
 
200 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1224  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.65 
 
 
190 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0396149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0018  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 
191 aa  190  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000168083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3856  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.78 
 
 
193 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0011  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.46 
 
 
189 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2670  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.09 
 
 
192 aa  190  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0484172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00010  constitutive 3-methyl-adenine DNA glycosylase I  49.45 
 
 
202 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4025  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.78 
 
 
193 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.612137  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.21 
 
 
209 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3921  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.78 
 
 
193 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.696634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>