More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3641 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2336  sulfate transporter  66.38 
 
 
703 aa  931    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0246739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3641  sulfate permease  100 
 
 
708 aa  1443    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  63.75 
 
 
736 aa  923    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0653  sulphate transporter  63.33 
 
 
708 aa  905    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.266407  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1320  sulfate permease  48.87 
 
 
694 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  47.69 
 
 
690 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2640  high affinity sulfate transporter (SulP)  44.25 
 
 
703 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2470  sulphate transporter  43.65 
 
 
706 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.760506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0985  sulphate transporter  41.29 
 
 
710 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1857  sulphate transporter  38.22 
 
 
702 aa  399  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.249315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  49.13 
 
 
584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  48.55 
 
 
588 aa  273  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  44 
 
 
571 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  36.64 
 
 
588 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  36.53 
 
 
574 aa  210  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.85 
 
 
585 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  33.82 
 
 
626 aa  204  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  33.85 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  35.22 
 
 
591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  34.34 
 
 
590 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  33.73 
 
 
605 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  34.12 
 
 
592 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  32.84 
 
 
583 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  35.15 
 
 
571 aa  191  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  34.94 
 
 
574 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  34.55 
 
 
577 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  35.6 
 
 
581 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  32.11 
 
 
603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  38.49 
 
 
586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  34.53 
 
 
578 aa  183  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  42.01 
 
 
608 aa  183  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  31.66 
 
 
588 aa  180  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.14 
 
 
572 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  35.49 
 
 
586 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  31.23 
 
 
711 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  32.71 
 
 
573 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  37.65 
 
 
558 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  38.51 
 
 
571 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  42.38 
 
 
584 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  42.2 
 
 
521 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  39.24 
 
 
574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  32.84 
 
 
730 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  30.4 
 
 
603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  30.21 
 
 
703 aa  164  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.79 
 
 
711 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  32.62 
 
 
570 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  32.47 
 
 
573 aa  161  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  37.25 
 
 
580 aa  162  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  30.3 
 
 
580 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  39.83 
 
 
521 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  38.13 
 
 
517 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  41.43 
 
 
620 aa  160  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  40.93 
 
 
522 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  31.12 
 
 
575 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  36.93 
 
 
580 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  29.76 
 
 
597 aa  159  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  33.77 
 
 
590 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  39.91 
 
 
546 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  31.63 
 
 
570 aa  158  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  29.91 
 
 
703 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  41.74 
 
 
521 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  29.88 
 
 
580 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  37.55 
 
 
517 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  40.19 
 
 
560 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  29.46 
 
 
599 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  33.02 
 
 
582 aa  147  5e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  38.43 
 
 
522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  36.44 
 
 
729 aa  147  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  39.29 
 
 
578 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  28.27 
 
 
584 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  39.37 
 
 
522 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  28.61 
 
 
576 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  28.99 
 
 
590 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  28.97 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  29.48 
 
 
596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  28.97 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  29.66 
 
 
583 aa  142  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  30.25 
 
 
588 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  36.24 
 
 
620 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  37.44 
 
 
585 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  28.92 
 
 
582 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  29.88 
 
 
601 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  38.36 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  28.44 
 
 
579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  26.61 
 
 
587 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  37.16 
 
 
698 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  35.66 
 
 
585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  35.16 
 
 
579 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  35.16 
 
 
579 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  37.61 
 
 
590 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5808  sulphate transporter  29.06 
 
 
497 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125757  normal  0.376579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  29.15 
 
 
576 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  28.44 
 
 
573 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  36.45 
 
 
567 aa  130  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  36.7 
 
 
585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  36.7 
 
 
585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  29.08 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  28.74 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  36.7 
 
 
585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  42.2 
 
 
521 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>