More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3627 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  100 
 
 
461 aa  934    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  55.75 
 
 
439 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  55.64 
 
 
482 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  47.06 
 
 
435 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  45.65 
 
 
476 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  42.95 
 
 
453 aa  322  8e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  28.74 
 
 
427 aa  143  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  30.38 
 
 
449 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 
471 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  29.31 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.8 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
420 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  29.31 
 
 
435 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  29.36 
 
 
459 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  32.03 
 
 
627 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.78 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.88 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  25 
 
 
418 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.53 
 
 
446 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.3 
 
 
437 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.68 
 
 
453 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  29.26 
 
 
525 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.09 
 
 
518 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.06 
 
 
456 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 
446 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
462 aa  87.4  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
433 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  29.04 
 
 
731 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.24 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 
419 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.53 
 
 
576 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  27.67 
 
 
635 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.7 
 
 
456 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 
443 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.17 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.78 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  25.42 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.15 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.53 
 
 
462 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 
1496 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  25.99 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  24.76 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 
431 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.23 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.75 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  29.32 
 
 
565 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.53 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 
972 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.26 
 
 
452 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 
431 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 
440 aa  77  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.65 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2820  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.92 
 
 
517 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.71 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.93 
 
 
501 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 
436 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  28.98 
 
 
448 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.76 
 
 
445 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 
498 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.23 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.63 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3648  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.54 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.32 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.3 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.77 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  25.28 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.65 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.5 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.79 
 
 
546 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.28 
 
 
469 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.79 
 
 
477 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 
441 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.23 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>