28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3584 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3584  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  100 
 
 
168 aa  327  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.621138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0376  flagellar biosynthesis protein FliO  47.27 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2214  flagellar biosynthesis protein FliO  45.08 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2916  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  42.31 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.465826  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2732  flagellar biosynthesis protein FliO  40.54 
 
 
118 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  38.75 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  38.75 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  38.75 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  38.75 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  38.75 
 
 
125 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
124 aa  54.3  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  34.78 
 
 
224 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  34.78 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  34.78 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  34.78 
 
 
211 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  34.78 
 
 
221 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  34.78 
 
 
221 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  34.78 
 
 
211 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  35.35 
 
 
221 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  34.78 
 
 
221 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.04 
 
 
187 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  24.32 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  29.55 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2977  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  30.91 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  36.94 
 
 
206 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  25.26 
 
 
133 aa  41.2  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.49 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>