More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3570 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3570  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 339 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1966  thiamine-monophosphate kinase  51.06 
 
 		 365 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  52.51 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0070  thiamine-monophosphate kinase  45.51 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  42.56 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  36.07 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  35.74 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.54 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1597  thiamine-monophosphate kinase  35.04 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  34.9 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  32.75 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11180  thiamine-phosphate kinase  34.63 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  35.63 
 
 		 319 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3747  thiamine monophosphate kinase  35.44 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.635061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  35.51 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  35.94 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3443  thiamine-monophosphate kinase  34.51 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.549222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  31.96 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  34.01 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  35.6 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  34.01 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  35.6 
 
 		 325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8005  Thiamine-phosphate kinase  35.33 
 
 		 318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  35.65 
 
 		 324 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  34.15 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  33.83 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  34.27 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  34.27 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  34.2 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  34.47 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  34.47 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  34.47 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  34.47 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  34.47 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  34.47 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  33.04 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0986  thiamine monophosphate kinase  36.69 
 
 		 375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  34.47 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  29.94 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  34.52 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  34.53 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  34.52 
 
 		 329 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  33.92 
 
 		 329 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  33.83 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  34.48 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  34.03 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  29.11 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2581  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  36.1 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  30.21 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1584  thiamine monophosphate kinase  36.65 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.0322048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  34.13 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  34.27 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  32.08 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  34.58 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  31.65 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.82 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  34.4 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  32.69 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  30.18 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  36.29 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  33.94 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  29.85 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  33.71 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.22 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  29.21 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  32.32 
 
 		 335 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.81 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  30.95 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1395  thiamine-monophosphate kinase  31.03 
 
 		 322 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  32.28 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  33.44 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  33.43 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  30.36 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  26.6 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  32.93 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  34.41 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  28.53 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  32.28 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  31.85 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0847  thiamine-monophosphate kinase  32.39 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.532066  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  30.24 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  33.13 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  32.14 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  32.74 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0204  thiamine-monophosphate kinase  33.72 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  28.87 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>