48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3563 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  100 
 
 
147 aa  308  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  37.75 
 
 
168 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  38.1 
 
 
150 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  46.97 
 
 
202 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  37.09 
 
 
170 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  37.09 
 
 
168 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  35.03 
 
 
178 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  37.5 
 
 
148 aa  98.6  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  34.94 
 
 
169 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.86 
 
 
278 aa  94.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  34.64 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  41.74 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  33.77 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  34.44 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  35.81 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  38.52 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  38.52 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  38.66 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  37.09 
 
 
158 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  43.24 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  29.93 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  27.55 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2757  hypothetical protein  30.36 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  29.47 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.29 
 
 
233 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.29 
 
 
233 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.29 
 
 
233 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.29 
 
 
233 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.29 
 
 
233 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.5 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  26.67 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.451187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  30.53 
 
 
236 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.33 
 
 
236 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  28.57 
 
 
241 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32 
 
 
354 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  29.67 
 
 
401 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.52 
 
 
232 aa  42  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0509  hypothetical protein  23.85 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  23.94 
 
 
402 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4206  hypothetical protein  23.27 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.372733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0802  copper homeostasis protein CutF  22.3 
 
 
124 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000203598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>