More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3544 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 464 aa  947    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  53.59 
 
 		 727 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  52.38 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  55.02 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  54.32 
 
 		 442 aa  472  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  50.64 
 
 		 467 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  47.44 
 
 		 492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  60.81 
 
 		 543 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  49.79 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  47.03 
 
 		 445 aa  435  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  47.67 
 
 		 471 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  47.56 
 
 		 588 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  48.79 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  47.66 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  45.9 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  36.88 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 		 487 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  33.26 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 489 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.12 
 
 		 506 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  31.89 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.25 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  31.75 
 
 		 561 aa  217  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  30.08 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 		 609 aa  211  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 582 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 474 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 481 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  30.62 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 573 aa  199  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.19 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 579 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  30.72 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 513 aa  196  9e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  33.99 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 581 aa  193  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  31.2 
 
 		 776 aa  183  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  37.86 
 
 		 608 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  29.05 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  30.18 
 
 		 706 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  26.01 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  29.61 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  29.33 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.95 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  31.76 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.41 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.28 
 
 		 335 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  33.53 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.84 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.55 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.39 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.59 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.54 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.59 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.73 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.74 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.89 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.57 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.7 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.34 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.86 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.22 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1702  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.02 
 
 		 375 aa  67  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.475579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>