182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3517 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  762    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  38.24 
 
 		 452 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  40.5 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  42.75 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2199  TOBE domain-containing protein  39.69 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  38.73 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3411  TOBE domain protein  33.33 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0167  TOBE domain protein  33.81 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2367  phage integrase family protein  38.92 
 
 		 211 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.683007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1780  TOBE domain protein  30.4 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2529  integrase family protein  32.51 
 
 		 218 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  34.88 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0871  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.01 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180666  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  31.65 
 
 		 141 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  35.11 
 
 		 141 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  29.75 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  34.92 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  31.01 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  36.84 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  32.35 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  33.57 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  30.38 
 
 		 141 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  32.54 
 
 		 177 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  29.75 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  31.18 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  33.81 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  31.41 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  31.25 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  30 
 
 		 262 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 290 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  30 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  30 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  30 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  30 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  30 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  30.63 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 254 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  31.95 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  30 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 254 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  32.68 
 
 		 269 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  29.49 
 
 		 138 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  34.27 
 
 		 269 aa  53.1  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  33.67 
 
 		 308 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  29.19 
 
 		 142 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  30.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  32 
 
 		 141 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  30.95 
 
 		 143 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 328 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  29.09 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  29.03 
 
 		 252 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  33.99 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  27.78 
 
 		 267 aa  50.4  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  30.63 
 
 		 278 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  34.51 
 
 		 270 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  34.51 
 
 		 270 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 263 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  26.84 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  32.29 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3762  phage integrase  34.05 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  28.92 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  29.8 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  24.24 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  34.72 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  26.55 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  27.78 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  25.57 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  35.51 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  32.54 
 
 		 139 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.78 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  27.78 
 
 		 265 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.61 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  26.44 
 
 		 263 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  30.53 
 
 		 140 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1134  tyrosine recombinase XerD  28.97 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  31.61 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  46.97 
 
 		 127 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  29.01 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  28.29 
 
 		 252 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  32.12 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  29.95 
 
 		 317 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.7 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>