More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3505 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  100 
 
 
314 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  76.11 
 
 
314 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  73.57 
 
 
314 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  59.47 
 
 
314 aa  381  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  57.32 
 
 
313 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  48.55 
 
 
323 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  47.88 
 
 
322 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.55 
 
 
312 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.02 
 
 
330 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  47.23 
 
 
322 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.11 
 
 
325 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1627  riboflavin biosynthesis protein RibF  49.04 
 
 
323 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.28 
 
 
320 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.94 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.35 
 
 
311 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.59 
 
 
315 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0364  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.35 
 
 
313 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000221325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.1 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.63 
 
 
318 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  41.2 
 
 
312 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.81 
 
 
319 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.08 
 
 
310 aa  228  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.12 
 
 
308 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.4 
 
 
311 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.85 
 
 
308 aa  225  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.31 
 
 
311 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.64 
 
 
311 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.03 
 
 
311 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229832  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.71 
 
 
311 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.03 
 
 
311 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.31 
 
 
311 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  43.54 
 
 
320 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.64 
 
 
311 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.64 
 
 
311 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.71 
 
 
311 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  36.21 
 
 
307 aa  222  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0952  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.54 
 
 
316 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.64 
 
 
311 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.64 
 
 
311 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.54 
 
 
311 aa  221  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.32 
 
 
309 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.69 
 
 
314 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.1 
 
 
310 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23420  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  42.86 
 
 
329 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.49 
 
 
312 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0709  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.72 
 
 
314 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.1 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.91 
 
 
308 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.34 
 
 
311 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000237633  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.93 
 
 
309 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1066  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.09 
 
 
315 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  0.0219323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.93 
 
 
309 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.16 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.3 
 
 
309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.56 
 
 
294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  39.38 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.91 
 
 
313 aa  215  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.74 
 
 
311 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3585  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.67 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.27 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2358  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.93 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.154524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.01 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000276676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3187  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  43.49 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.96 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0648  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.86 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0693294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.07 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0805  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.72 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.87 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60380  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.96 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000478317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1733  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.56 
 
 
320 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4560  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.86 
 
 
316 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.270493  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.83 
 
 
319 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.78 
 
 
311 aa  210  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.14 
 
 
311 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.58 
 
 
317 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0602  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.2 
 
 
316 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.51 
 
 
311 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4025  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.11 
 
 
307 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  41.21 
 
 
313 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.06 
 
 
309 aa  209  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03031  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.41 
 
 
289 aa  208  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0128028  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0503  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.46 
 
 
320 aa  208  8e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3272  bifunctional riboflavin kinase and FMN adenylyltransferase  37.79 
 
 
310 aa  208  9e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1675  FMN adenylyltransferase  39.13 
 
 
345 aa  207  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  40.51 
 
 
306 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5826  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.36 
 
 
326 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575935  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.46 
 
 
321 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0643  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.86 
 
 
322 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.81 
 
 
311 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000080021  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2348  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.81 
 
 
324 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400291  hitchhiker  0.00462783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.34 
 
 
306 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  42.21 
 
 
320 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0188  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.81 
 
 
314 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07060  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  39.32 
 
 
325 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.55 
 
 
330 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.97 
 
 
316 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.33 
 
 
325 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4052  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.84 
 
 
313 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.86 
 
 
311 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.19 
 
 
323 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>