More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3501 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  52.19 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  47.01 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  43.82 
 
 		 398 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  57.14 
 
 		 438 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  40.72 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  39.22 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  36.24 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  31.03 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  29.68 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  34.86 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  33.47 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  32.64 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  32.73 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  32.73 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  32.98 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  29.96 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  31.2 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  33.47 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.76 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  32.27 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  32.76 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  28.76 
 
 		 235 aa  95.5  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  25.45 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  30.59 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  25.91 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  36.4 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  35.44 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  26.05 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  27.98 
 
 		 228 aa  90.1  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  30.77 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  29.65 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  27.48 
 
 		 241 aa  89  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  27.48 
 
 		 241 aa  89  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  34.6 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  31.08 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  23.83 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  28.07 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  31.19 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  25.45 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  28.51 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  23.18 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  25.11 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  28.51 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  26.07 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.72 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.68 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  24.09 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  33.33 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  28.17 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  26.58 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  32.37 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  30.77 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  23.64 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  28.07 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  28.07 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  28.07 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  28.07 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  28.07 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  28.07 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  27.63 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  28.07 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  31.47 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  27.9 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  25.23 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  24.88 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.08 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  24.36 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  32.29 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22.62 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  24.89 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  26.42 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  29.91 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  32.27 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  27.07 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1571  hypothetical protein  26.07 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1419  hypothetical protein  26.09 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  31.22 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  25.54 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  32.18 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  25.22 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  21.08 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  24.19 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  33.58 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  26.47 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  22.37 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  30.41 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  26.44 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  32.18 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  34.67 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  27.27 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  27.49 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  28.38 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>