More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3499 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  52.74 
 
 		 1033 aa  1097    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  42.78 
 
 		 1032 aa  692    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  41.73 
 
 		 1050 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  48.17 
 
 		 1027 aa  939    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  41.26 
 
 		 1089 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  100 
 
 		 1089 aa  2213    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  38.09 
 
 		 1232 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  45.67 
 
 		 1174 aa  902    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  61.93 
 
 		 1244 aa  1154    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  61.04 
 
 		 1127 aa  1353    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  39.51 
 
 		 1001 aa  612  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  38.14 
 
 		 1075 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  40.11 
 
 		 1124 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  38.63 
 
 		 1161 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  38.96 
 
 		 1062 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  42.27 
 
 		 1078 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  41.41 
 
 		 1082 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  38.55 
 
 		 1132 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  57.35 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  56.32 
 
 		 446 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  50 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  53.24 
 
 		 408 aa  436  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  50.12 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  50.36 
 
 		 411 aa  379  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  43.86 
 
 		 414 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  30.63 
 
 		 457 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  33.87 
 
 		 409 aa  219  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  33.64 
 
 		 401 aa  194  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.75 
 
 		 685 aa  189  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 681 aa  188  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  29.16 
 
 		 726 aa  187  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  31.54 
 
 		 372 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  28.98 
 
 		 394 aa  181  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 394 aa  180  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  27.76 
 
 		 393 aa  179  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  30.9 
 
 		 706 aa  175  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  28.98 
 
 		 394 aa  175  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 779 aa  173  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  27.66 
 
 		 696 aa  168  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.13 
 
 		 729 aa  168  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  30.99 
 
 		 646 aa  167  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  29.93 
 
 		 380 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  26.42 
 
 		 424 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  28.64 
 
 		 630 aa  165  3e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  27.12 
 
 		 689 aa  164  6e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.94 
 
 		 758 aa  163  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.69 
 
 		 689 aa  164  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.23 
 
 		 730 aa  163  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 373 aa  162  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  26.24 
 
 		 634 aa  162  4e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.07 
 
 		 729 aa  160  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.73 
 
 		 640 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 797 aa  160  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  25.19 
 
 		 638 aa  160  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.61 
 
 		 718 aa  160  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.59 
 
 		 751 aa  159  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.21 
 
 		 735 aa  159  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.65 
 
 		 768 aa  157  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  30.26 
 
 		 712 aa  157  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 		 659 aa  157  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.61 
 
 		 755 aa  156  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 816 aa  156  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.44 
 
 		 757 aa  155  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.69 
 
 		 759 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 760 aa  154  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  29.94 
 
 		 732 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.09 
 
 		 730 aa  154  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.29 
 
 		 763 aa  154  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.09 
 
 		 730 aa  154  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  29.5 
 
 		 396 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 731 aa  152  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  26.36 
 
 		 770 aa  151  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7799  UvrD/REP helicase  30.73 
 
 		 787 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 686 aa  150  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 		 786 aa  150  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  26.44 
 
 		 682 aa  149  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  29.45 
 
 		 717 aa  148  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.12 
 
 		 768 aa  148  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  32.69 
 
 		 742 aa  148  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 804 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  26.92 
 
 		 742 aa  146  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 708 aa  146  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.17 
 
 		 851 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 659 aa  145  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.11 
 
 		 766 aa  145  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 		 714 aa  145  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4232  UvrD/REP helicase  30.68 
 
 		 674 aa  145  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 681 aa  144  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  28.98 
 
 		 746 aa  144  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 726 aa  144  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  35.88 
 
 		 758 aa  143  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  29.26 
 
 		 789 aa  142  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27560  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.76 
 
 		 699 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 		 715 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  32.06 
 
 		 759 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.77 
 
 		 743 aa  141  4.999999999999999e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.96 
 
 		 772 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0715  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 690 aa  139  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3496  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 717 aa  139  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>