More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3493 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3493  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
108 aa  217  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 
113 aa  149  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 
113 aa  147  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  57.55 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  57.55 
 
 
113 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.89 
 
 
113 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
113 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50 
 
 
112 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.23 
 
 
112 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  98.6  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.28 
 
 
112 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
113 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.66 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
121 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.28 
 
 
110 aa  97.1  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.11 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  95.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  46.23 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  48.11 
 
 
116 aa  94.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0565  nitrogen regulatory protein P-II 2  44.86 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.941752  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.79 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0522  nitrogen regulatory protein P-II 2  44.86 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.17 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0506  nitrogen regulatory protein P-II 2  44.86 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0503  nitrogen regulatory protein P-II 2  44.86 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0597213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0512  nitrogen regulatory protein P-II 2  44.86 
 
 
112 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4056  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  94  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  43.93 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.17 
 
 
112 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.23 
 
 
112 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  46.23 
 
 
112 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.23 
 
 
112 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00402  nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  44.86 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  44.95 
 
 
111 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  43.93 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
114 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>