More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3133 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  43.48 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  43.27 
 
 		 137 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  42.31 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  42.31 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  35.81 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  51.52 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  34.12 
 
 		 685 aa  72  0.000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  52.24 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  32.71 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  28.15 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  40.96 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  39.81 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  36.17 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  37.23 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0580  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.14 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  31.19 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  32.59 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  29.09 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.68 
 
 		 390 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0957  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 179 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.68 
 
 		 387 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  33.86 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  37.07 
 
 		 390 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  38.37 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  30.22 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  35.35 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  32.04 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.58 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  32.04 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  32.04 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  32.04 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  32.04 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  31.07 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  40.54 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  32.04 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  38.37 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  38.37 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  29.36 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  38.37 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  38.37 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  27.34 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.57 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  28.44 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.24 
 
 		 390 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.07 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.92 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  28.44 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  41.43 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  33.82 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  32.98 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  37.21 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  29.36 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4649  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 238 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  31.06 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 185 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  40.28 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  26.62 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31.06 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  29.53 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.86 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2168  Rhodanese domain protein  35.8 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  33.6 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  41.82 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>