More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3124 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  62.21 
 
 		 807 aa  1030    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 807 aa  1657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  58.4 
 
 		 802 aa  913    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  64.53 
 
 		 807 aa  1054    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  54.28 
 
 		 778 aa  824    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  51.12 
 
 		 812 aa  777    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  42.91 
 
 		 804 aa  595  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  41.79 
 
 		 797 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  39.85 
 
 		 818 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  40.79 
 
 		 862 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  40.3 
 
 		 773 aa  548  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  39.78 
 
 		 841 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  37.78 
 
 		 829 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  39.68 
 
 		 831 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 		 795 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  37.51 
 
 		 827 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  40.12 
 
 		 818 aa  522  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  38.27 
 
 		 831 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  38.88 
 
 		 843 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 		 796 aa  515  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 819 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  39.07 
 
 		 804 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  37.52 
 
 		 819 aa  511  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  37.52 
 
 		 819 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  38.26 
 
 		 830 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  38.59 
 
 		 832 aa  499  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  38.6 
 
 		 830 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  37.37 
 
 		 835 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 		 817 aa  495  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  37.41 
 
 		 830 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  35.84 
 
 		 809 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 		 819 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 818 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 		 804 aa  485  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  36.02 
 
 		 852 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  37.1 
 
 		 823 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  37.26 
 
 		 830 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  39.09 
 
 		 838 aa  482  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  36.99 
 
 		 810 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 		 808 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  37.65 
 
 		 805 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  36.4 
 
 		 823 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  36.07 
 
 		 793 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  36.28 
 
 		 803 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  36.18 
 
 		 815 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  36.84 
 
 		 817 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  36.07 
 
 		 793 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  35.44 
 
 		 833 aa  472  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  35.61 
 
 		 804 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  36.87 
 
 		 805 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  36.7 
 
 		 833 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  36.7 
 
 		 805 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 857 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 		 814 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  35.73 
 
 		 814 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  35.71 
 
 		 818 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  35.52 
 
 		 803 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  35.09 
 
 		 814 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  37.08 
 
 		 800 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  36.06 
 
 		 846 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  36.02 
 
 		 791 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  36.22 
 
 		 852 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  37.32 
 
 		 908 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  36.54 
 
 		 796 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  35.89 
 
 		 852 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  35.81 
 
 		 852 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  36.16 
 
 		 792 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  38.03 
 
 		 808 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  36.01 
 
 		 791 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 803 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  34.67 
 
 		 817 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  34.44 
 
 		 777 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  34.88 
 
 		 823 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  35.89 
 
 		 779 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  36.18 
 
 		 799 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  34.67 
 
 		 817 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  36.02 
 
 		 794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 797 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  35.96 
 
 		 799 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 		 793 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  34.43 
 
 		 817 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  36.9 
 
 		 790 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  36.01 
 
 		 805 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  35.78 
 
 		 791 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  34.24 
 
 		 817 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  37.09 
 
 		 802 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  33.17 
 
 		 794 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  36.04 
 
 		 797 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  35.49 
 
 		 797 aa  438  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 797 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 797 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  35.8 
 
 		 777 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 797 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 797 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 824 aa  436  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  35.09 
 
 		 797 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  35.35 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 797 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  35.22 
 
 		 797 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>