125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3109 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  67.36 
 
 
262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  67.37 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  59.83 
 
 
262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  67.8 
 
 
264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  66.95 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  66.95 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  67.37 
 
 
264 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  66.95 
 
 
264 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  66.53 
 
 
264 aa  309  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  66.53 
 
 
264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  66.53 
 
 
264 aa  308  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  66.1 
 
 
264 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  68.38 
 
 
248 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  68.38 
 
 
248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  64.41 
 
 
264 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  67.95 
 
 
248 aa  298  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  65.25 
 
 
248 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  58.44 
 
 
259 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  55.7 
 
 
259 aa  292  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  62.08 
 
 
253 aa  292  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  58.92 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  55.19 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  57.85 
 
 
270 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  53.62 
 
 
261 aa  279  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  58.4 
 
 
266 aa  278  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  56.67 
 
 
327 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  56.84 
 
 
251 aa  275  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  56.49 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  58.75 
 
 
264 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  58.23 
 
 
260 aa  270  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  55.83 
 
 
267 aa  269  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  58.23 
 
 
260 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  57.81 
 
 
263 aa  267  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  57.81 
 
 
260 aa  267  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  57.38 
 
 
260 aa  266  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  57.81 
 
 
260 aa  267  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  57.38 
 
 
260 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  57.81 
 
 
260 aa  267  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  56.96 
 
 
259 aa  265  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  54.55 
 
 
267 aa  248  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  53.39 
 
 
244 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  52.97 
 
 
291 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  52.97 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  54.7 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  57.2 
 
 
265 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  56.79 
 
 
265 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  50.82 
 
 
338 aa  240  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  55.6 
 
 
256 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  52.26 
 
 
336 aa  238  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  54.89 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  53.85 
 
 
234 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  56.65 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  56.65 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  53.48 
 
 
233 aa  214  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  47.48 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  45.96 
 
 
228 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  42.98 
 
 
316 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  40.85 
 
 
340 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  48.29 
 
 
253 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  47.86 
 
 
269 aa  175  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  47.01 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  46.81 
 
 
319 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  38.03 
 
 
225 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  38.16 
 
 
218 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  36.17 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  35.22 
 
 
225 aa  128  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  34.89 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  36.09 
 
 
254 aa  126  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  34.45 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  35.66 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  35.25 
 
 
247 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  34.69 
 
 
247 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  34.84 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  31.88 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  31.69 
 
 
305 aa  111  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  33.48 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  30.13 
 
 
224 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  33.02 
 
 
221 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  31.93 
 
 
225 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  33.47 
 
 
246 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  33.48 
 
 
233 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  31.51 
 
 
225 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  29.96 
 
 
243 aa  101  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  31 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  31.28 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  32.08 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  32.13 
 
 
220 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  32.13 
 
 
220 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  33.05 
 
 
263 aa  95.1  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  31.44 
 
 
222 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  32 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  32.89 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45624  predicted protein  28.46 
 
 
298 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  31.75 
 
 
349 aa  85.9  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  30.29 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  31.12 
 
 
228 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  34.31 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  30.14 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  28.89 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>