More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3100 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  100 
 
 		 312 aa  631  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  60.45 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  50.26 
 
 		 390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  56.15 
 
 		 318 aa  358  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  54.87 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  55.52 
 
 		 316 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  55.97 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  51.06 
 
 		 336 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  49.84 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  50.32 
 
 		 318 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  48.42 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  46.6 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  44.15 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  42 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  39.1 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  40.51 
 
 		 342 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  38.85 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  39.87 
 
 		 326 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  41.29 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  41.03 
 
 		 313 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  39.32 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  38.29 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  38.29 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.81 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  38.29 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  38.29 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  38.29 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  40.19 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  39.24 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  39.56 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  40.13 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  37.91 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  37.62 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  37.38 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  37.38 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  36.45 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  37.38 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  37.38 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  37.38 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  37.38 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  37.38 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  39.16 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  37.5 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  35.2 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  34.76 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  34.84 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  32.08 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  32.08 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  32.08 
 
 		 318 aa  148  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  35.08 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  33.33 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  33.02 
 
 		 322 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  34.23 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  33.79 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  34.59 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  31.17 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  32.34 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  32.04 
 
 		 309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  32.24 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  32.91 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  33.56 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  32.35 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  33.01 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  30.57 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  30.57 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  32.03 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  31.05 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  30.67 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.55 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  32.35 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  32.26 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  30.26 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  31.91 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  31.91 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  31.91 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  31.91 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  34.01 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  31.67 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  31.7 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  34.24 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  32.26 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  31.37 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  31.37 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  32.35 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  31.56 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  30.92 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  32.13 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  30 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  32.32 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  30.29 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  29.61 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  31.25 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  30.26 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  30.62 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  29.04 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  29.37 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  30.72 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  30.72 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  31.99 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>