More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3077 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
328 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2661  metal dependent phosphohydrolase  67.38 
 
 
327 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2294  metal dependent phosphohydrolase  62.8 
 
 
328 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3076  metal dependent phosphohydrolase  50.16 
 
 
338 aa  326  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2662  metal dependent phosphohydrolase  48.24 
 
 
338 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2178  metal dependent phosphohydrolase  41.08 
 
 
335 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2293  metal dependent phosphohydrolase  38.56 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2625  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.756444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3373  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0887  metal dependent phosphohydrolase  28.44 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.665432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2714  metal dependent phosphohydrolase  27.13 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0057  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 
317 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0545  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3495  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 
320 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0533  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
316 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.164629  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
1073 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  37.56 
 
 
419 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
320 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 
320 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 
306 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 
545 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  39.33 
 
 
550 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  29.49 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  37 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  39.24 
 
 
453 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 
718 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.68 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 
1237 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 
513 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.34 
 
 
353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0316  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 
320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  38.98 
 
 
427 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
345 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  39.01 
 
 
1171 aa  116  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  38.98 
 
 
414 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 
506 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
399 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
375 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.79 
 
 
880 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.79 
 
 
860 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 
357 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.68 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  39.18 
 
 
792 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0385  metal dependent phosphohydrolase  43.36 
 
 
199 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  36.36 
 
 
308 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 
462 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  44.2 
 
 
836 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
651 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.2 
 
 
841 aa  113  5e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
553 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
372 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 
868 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.89 
 
 
394 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  39.76 
 
 
311 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
861 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
377 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  38.51 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
719 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6715  metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2492  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 
195 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200844 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 
463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  34.81 
 
 
294 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 
491 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  37.93 
 
 
338 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  38.16 
 
 
564 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 
402 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  37.71 
 
 
740 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4475  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 
249 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118012  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  29.92 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  30.8 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 
483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  29.31 
 
 
392 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
397 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  37.71 
 
 
431 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
444 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  37.14 
 
 
402 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.92 
 
 
496 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 
508 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  32.59 
 
 
409 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  33.82 
 
 
509 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  36.88 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 
357 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  28.62 
 
 
411 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.68 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>