More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3062 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3062  alcohol dehydrogenase, iron-containing  100 
 
 		 392 aa  811    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1315  iron-containing alcohol dehydrogenase  68.19 
 
 		 393 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00399171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2244  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.21 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0334  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.91 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0480  iron-containing alcohol dehydrogenase  59.59 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121131 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1381  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.02 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1911  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.93 
 
 		 386 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0885736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3921  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.01 
 
 		 389 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.49 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0784  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.97 
 
 		 310 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000947408 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.06 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  35.66 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.57 
 
 		 382 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1552  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  37.5 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  34.44 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  36.32 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.32 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  36.2 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  35.31 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.76 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.71 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.29 
 
 		 382 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 387 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  35.57 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.46 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.15 
 
 		 387 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3240  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.34 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.81 
 
 		 402 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.13 
 
 		 390 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.7 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.61 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0394  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.394023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.47 
 
 		 389 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.07 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.6 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4732  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.42 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.942125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.29 
 
 		 400 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  33.68 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 		 383 aa  200  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 		 398 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.08 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.83 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  33.67 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.29 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  33.67 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.29 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0563  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.165056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.01 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  33.76 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.33 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_53  alcohol dehydrogenase, iron-containing  38.1 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.83 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  33.42 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0053  alcohol dehydrogenase, iron-containing  37.78 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.4 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2674  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.74 
 
 		 371 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000116662  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0050  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000032354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.87 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  33.16 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  34.85 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.69 
 
 		 384 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  34.63 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  34.63 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>