More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3012 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
186 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  74.73 
 
 
186 aa  296  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  73.12 
 
 
186 aa  286  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  69.19 
 
 
193 aa  271  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  65.24 
 
 
187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  61.62 
 
 
188 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  52.75 
 
 
182 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
182 aa  191  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
182 aa  189  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
182 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
183 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
185 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 
206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
215 aa  165  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  42.62 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
201 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
203 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
201 aa  160  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
190 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  42.62 
 
 
183 aa  156  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
189 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
186 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  45.2 
 
 
186 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  44.63 
 
 
186 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 
212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
184 aa  142  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
190 aa  140  8e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2110  orotate phosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
189 aa  140  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1305  orotate phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
192 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
198 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
187 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
179 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
187 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
187 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
185 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
177 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 
191 aa  123  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
187 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
192 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 
195 aa  122  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 
188 aa  121  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 
194 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
194 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  36 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  35 
 
 
178 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 
177 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
174 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
189 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  42.95 
 
 
191 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
182 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 
192 aa  104  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  38.41 
 
 
179 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 
191 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
186 aa  101  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
185 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
185 aa  100  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
199 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
185 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 
178 aa  94.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
215 aa  94  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 
185 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  39.57 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
196 aa  90.9  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  29.88 
 
 
500 aa  89.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
197 aa  89  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0289  orotate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
201 aa  88.6  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000476622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 
175 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>