249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3001 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  50.16 
 
 
308 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1459  domain of unknown function DUF1731  48.73 
 
 
318 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.812014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  38.87 
 
 
307 aa  238  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  40.26 
 
 
306 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0133  domain of unknown function DUF1731  43.38 
 
 
316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  41.14 
 
 
305 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  38.85 
 
 
306 aa  232  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  39.3 
 
 
307 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  39.3 
 
 
307 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  40.32 
 
 
307 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  39.43 
 
 
306 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  42.07 
 
 
311 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  35.14 
 
 
301 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  36.94 
 
 
301 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  38.02 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  37.9 
 
 
302 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  37.97 
 
 
297 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  41.1 
 
 
310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.82 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  37.9 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.19 
 
 
301 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  37.26 
 
 
313 aa  211  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  37.97 
 
 
304 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  34.5 
 
 
301 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  40.06 
 
 
302 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  34.19 
 
 
301 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  40.71 
 
 
297 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  34.19 
 
 
301 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  40.58 
 
 
297 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  34.19 
 
 
301 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  40.58 
 
 
297 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  40.71 
 
 
297 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  40.58 
 
 
297 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  40.58 
 
 
297 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  40.71 
 
 
297 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  40.71 
 
 
297 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  40.71 
 
 
297 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  40.71 
 
 
297 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  39.23 
 
 
312 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  40.38 
 
 
297 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  34.5 
 
 
301 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  38.26 
 
 
313 aa  208  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  40.26 
 
 
297 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  34.19 
 
 
301 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4903  domain of unknown function DUF1731  41.21 
 
 
314 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.810093  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  38.91 
 
 
313 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  40.51 
 
 
300 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  40.38 
 
 
297 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  37.62 
 
 
312 aa  205  8e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.74 
 
 
297 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  38.32 
 
 
301 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004147  cell division inhibitor  38.01 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  38.26 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  40 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1477  domain of unknown function DUF1731  38.98 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  36.96 
 
 
307 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  39.1 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  37.82 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1663  hypothetical protein  37.19 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00364793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.05 
 
 
321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  39.05 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  36.1 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 
299 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.897433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  36.22 
 
 
297 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0501  rcp protein  35.35 
 
 
304 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  39.3 
 
 
297 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  37.58 
 
 
296 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  36.39 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  35.14 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  36.74 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  35.14 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.74 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  36.74 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02301  putative sugar nucleotide epimerase  33.55 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.855425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  35.14 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  35.14 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  38.22 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1699  hypothetical protein  34.48 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30806  normal  0.296517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  34.38 
 
 
304 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  37.9 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  37.9 
 
 
296 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2912  domain of unknown function DUF1731  39.24 
 
 
313 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0344654  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2911  hypothetical protein  34.39 
 
 
297 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  36.94 
 
 
373 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1778  hypothetical protein  38.26 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00178055  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0806  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0934  hypothetical protein  38.66 
 
 
299 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.209626  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  34.08 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0810  hypothetical protein  32.8 
 
 
300 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  35.05 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  35.05 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01320  hypothetical protein  37.3 
 
 
316 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  35.05 
 
 
499 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0794  hypothetical protein  32.8 
 
 
300 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2643  hypothetical protein  38.78 
 
 
301 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131781  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6071  domain of unknown function DUF1731  36.28 
 
 
303 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  40.26 
 
 
299 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4731  hypothetical protein  37.14 
 
 
300 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.083887  normal  0.818487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  36.86 
 
 
489 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>