More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2989 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0706  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000240692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 397 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 397 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  78.89 
 
 		 396 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  78.89 
 
 		 396 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  76.88 
 
 		 396 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 397 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0695  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 397 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000151586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2634  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000354854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2649  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000546153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  76.44 
 
 		 397 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1628  elongation factor Tu  87.15 
 
 		 397 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0447  elongation factor Tu  89.42 
 
 		 397 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2067  translation elongation factor Tu  83.67 
 
 		 398 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000442847  normal  0.246821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2989  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  804    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1447  elongation factor Tu  87.66 
 
 		 397 aa  683    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  76.88 
 
 		 396 aa  634    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.94 
 
 		 396 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  702    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0495  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 394 aa  638    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2080  translation elongation factor Tu  83.67 
 
 		 398 aa  637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.690947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  85.89 
 
 		 397 aa  702    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  76.69 
 
 		 396 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  76.07 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  77.33 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.63 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  78.2 
 
 		 399 aa  628  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3599  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0100711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3797  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000312567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  75.69 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 396 aa  627  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0391  elongation factor Tu  78.39 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.578399  decreased coverage  0.00326089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0403  elongation factor Tu  78.39 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000926456  normal  0.170531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775684  hitchhiker  0.000000000148389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08680  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000467002  hitchhiker  0.000980752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08830  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0517061  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  75.76 
 
 		 394 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>