More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2977 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  280  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  68.12 
 
 		 138 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  61.36 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 168 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 154 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 137 aa  150  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  53.03 
 
 		 135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  57.89 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  46.21 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 142 aa  72  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 204 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  43.3 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  43.3 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  43.24 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 165 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  38.75 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.79 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  35.85 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 148 aa  57  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>