172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2954 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2954  BioY family protein  100 
 
 
180 aa  337  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.716157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  58.2 
 
 
189 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  58.24 
 
 
182 aa  167  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  42.77 
 
 
169 aa  109  2e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  42.77 
 
 
169 aa  109  2e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  41.11 
 
 
187 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  34.97 
 
 
184 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  41.06 
 
 
187 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  48.28 
 
 
193 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2889  BioY protein  36.76 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  38.86 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  41.14 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  40.4 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  36.25 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.75885e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0568  BioY protein  48.28 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.936427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  36.52 
 
 
203 aa  91.7  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.63296e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  45.4 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  36.97 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  34.73 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 
192 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  44.6 
 
 
169 aa  88.6  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  42.58 
 
 
203 aa  87  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  37.74 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  39.86 
 
 
195 aa  84  1e-15  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  35.33 
 
 
182 aa  83.2  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  33.96 
 
 
184 aa  82  4e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  39.44 
 
 
197 aa  81.6  5e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  36.96 
 
 
182 aa  81.6  6e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  41.18 
 
 
189 aa  80.9  9e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  34.46 
 
 
176 aa  80.9  1e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02230  hypothetical protein  37.84 
 
 
188 aa  80.5  1e-14  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  43.04 
 
 
199 aa  79.7  2e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0659  BioY protein  33.33 
 
 
171 aa  79.7  2e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.728186  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  33.92 
 
 
194 aa  79.3  3e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  35.95 
 
 
190 aa  78.6  5e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  40.3 
 
 
235 aa  78.2  6e-14  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  36.23 
 
 
192 aa  77.8  7e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  41.01 
 
 
207 aa  77.8  9e-14  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  39.88 
 
 
192 aa  76.6  2e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.11 
 
 
190 aa  76.6  2e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  34.16 
 
 
182 aa  76.3  2e-13  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  39.86 
 
 
206 aa  74.7  6e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  43.64 
 
 
195 aa  73.6  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  48.84 
 
 
212 aa  73.9  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  31.65 
 
 
197 aa  72.8  2e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  45.36 
 
 
187 aa  72.4  3e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  52.56 
 
 
231 aa  72  4e-12  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  31.65 
 
 
197 aa  72.4  4e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  31.65 
 
 
197 aa  72.4  4e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  32.37 
 
 
197 aa  71.6  5e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  33.81 
 
 
198 aa  72  5e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  31.65 
 
 
197 aa  71.2  6e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.12597e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  30.94 
 
 
197 aa  71.2  7e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  31.65 
 
 
197 aa  71.2  7e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  31.65 
 
 
197 aa  71.2  7e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  3.60294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  31.65 
 
 
197 aa  71.2  8e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  30.94 
 
 
197 aa  70.9  1e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.01818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  34.56 
 
 
191 aa  70.5  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  7.0307e-10  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  40.52 
 
 
193 aa  70.1  1e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  35.21 
 
 
191 aa  69.7  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.66456e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  38.51 
 
 
191 aa  69.7  2e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  38.03 
 
 
205 aa  69.7  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  38.51 
 
 
191 aa  69.7  2e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  40 
 
 
201 aa  70.1  2e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  37.06 
 
 
212 aa  69.7  2e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  43.06 
 
 
180 aa  69.7  2e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  41.83 
 
 
199 aa  68.9  3e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  33.8 
 
 
191 aa  68.6  4e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  34.59 
 
 
184 aa  68.6  5e-11  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.22 
 
 
184 aa  68.2  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.22 
 
 
184 aa  68.2  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  44.44 
 
 
216 aa  68.2  6e-11  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  34.62 
 
 
189 aa  68.2  7e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  35.26 
 
 
169 aa  67.8  8e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  41.35 
 
 
203 aa  67.4  9e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  35.71 
 
 
180 aa  67.4  1e-10  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  36.21 
 
 
187 aa  67  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  32.57 
 
 
202 aa  66.6  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  9.12957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  38.24 
 
 
197 aa  65.9  3e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  45.74 
 
 
224 aa  65.9  3e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  36.31 
 
 
187 aa  65.5  4e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  37.01 
 
 
205 aa  65.1  5e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  45.98 
 
 
208 aa  65.1  6e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  36.07 
 
 
197 aa  64.7  6e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  43.14 
 
 
197 aa  64.7  7e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.1 
 
 
182 aa  64.3  8e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  36.8 
 
 
188 aa  64.3  8e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.91401e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  37.41 
 
 
208 aa  64.3  9e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  39.74 
 
 
205 aa  63.5  1e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  37.14 
 
 
216 aa  63.5  2e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  38.41 
 
 
192 aa  63.2  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  48.15 
 
 
187 aa  63.2  2e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.05792e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  34.97 
 
 
179 aa  63.2  2e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  33.33 
 
 
190 aa  63.2  2e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.28 
 
 
192 aa  62.8  3e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  36.84 
 
 
199 aa  62.8  3e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  36.36 
 
 
185 aa  62.4  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  35 
 
 
202 aa  62  4e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  35 
 
 
202 aa  62  4e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  35 
 
 
202 aa  62  4e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>