More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2946 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  100 
 
 
359 aa  735    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  61.34 
 
 
388 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  65.28 
 
 
378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  62.11 
 
 
360 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  60.51 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  54.9 
 
 
387 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  46.05 
 
 
407 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  45.2 
 
 
367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  46.33 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  45.11 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  45.71 
 
 
382 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  47.16 
 
 
389 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  45.99 
 
 
385 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  46 
 
 
383 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  46.63 
 
 
379 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  41.23 
 
 
405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  45.97 
 
 
395 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  47.75 
 
 
413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  48.42 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  45.18 
 
 
398 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  46.36 
 
 
403 aa  259  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  42.72 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  45.37 
 
 
368 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  44.29 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  44.3 
 
 
359 aa  246  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  39.59 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  42.21 
 
 
436 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  41.78 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  41.2 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  41.2 
 
 
308 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  42.33 
 
 
389 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  42.47 
 
 
393 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  40.88 
 
 
389 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  43.29 
 
 
357 aa  238  9e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  39.81 
 
 
498 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  39.17 
 
 
503 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  42.75 
 
 
309 aa  236  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  40.57 
 
 
386 aa  235  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  41.61 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  42.28 
 
 
355 aa  232  6e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  40.65 
 
 
379 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  40.43 
 
 
333 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  42.14 
 
 
406 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  43.33 
 
 
451 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  43.45 
 
 
397 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  43.45 
 
 
397 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  43.33 
 
 
451 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  39.32 
 
 
350 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  41.12 
 
 
382 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  39.32 
 
 
350 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  41 
 
 
447 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  42.11 
 
 
382 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  39.2 
 
 
383 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  40.33 
 
 
383 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40.79 
 
 
384 aa  222  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  42.91 
 
 
347 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  38.06 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  42.33 
 
 
471 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  40.32 
 
 
464 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  40.73 
 
 
475 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  41.34 
 
 
378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  40.45 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  40.59 
 
 
477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  37.65 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  39.39 
 
 
378 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  39.71 
 
 
376 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  40.34 
 
 
457 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  40.8 
 
 
362 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  41.36 
 
 
435 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  40.72 
 
 
465 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  40.34 
 
 
400 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  41.92 
 
 
360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  40.53 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  41.33 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  41.89 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  41.55 
 
 
405 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  41.55 
 
 
393 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  39.47 
 
 
395 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  40.67 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  41.22 
 
 
393 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  40.55 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  38.82 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  41.92 
 
 
464 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  40.33 
 
 
452 aa  212  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  38.03 
 
 
395 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  38.83 
 
 
394 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  41.04 
 
 
445 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  40.33 
 
 
456 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.33 
 
 
351 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  39.19 
 
 
399 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  39.19 
 
 
400 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  39.8 
 
 
393 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  39.8 
 
 
393 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  39.52 
 
 
362 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  40.07 
 
 
437 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  40.07 
 
 
449 aa  208  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  40.07 
 
 
437 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  40.07 
 
 
437 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  40.07 
 
 
454 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.93 
 
 
386 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>