More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2876 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
377 aa  777  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  40.83 
 
 
353 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 
361 aa  163  5e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
347 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  38.66 
 
 
305 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
306 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
363 aa  148  2e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.23 
 
 
367 aa  139  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
308 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
274 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
322 aa  131  2e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  3.58404e-05 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
352 aa  131  2e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
280 aa  130  5e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
277 aa  129  1e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  5.84386e-06 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
398 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
280 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  30.09 
 
 
332 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
321 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
364 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 
384 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
341 aa  122  1e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 
373 aa  121  2e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
351 aa  121  2e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
327 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  37.56 
 
 
336 aa  120  4e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
338 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 
365 aa  119  1e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  37.07 
 
 
321 aa  118  2e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
334 aa  117  2e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.19 
 
 
341 aa  118  2e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.33 
 
 
340 aa  115  2e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
663 aa  114  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
235 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
347 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
330 aa  114  4e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  1.20628e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
342 aa  111  2e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
727 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
321 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
1250 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
339 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.72 
 
 
330 aa  110  4e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
318 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
330 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
336 aa  109  9e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
300 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
344 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
340 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
304 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
334 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
318 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
244 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
397 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
282 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
338 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
269 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
299 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
367 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
1035 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
262 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
334 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
337 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
294 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.23 
 
 
300 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
345 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
341 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
322 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
334 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
334 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
351 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
316 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  31.73 
 
 
299 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  9.37683e-12 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
373 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.43 
 
 
349 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
333 aa  100  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.06 
 
 
255 aa  99.4  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 
294 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2728  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
812 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
930 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
773 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
333 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
333 aa  96.7  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  30.77 
 
 
295 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
323 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.44 
 
 
312 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.85438e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  29.79 
 
 
258 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
1067 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  32 
 
 
318 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
373 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  27.14 
 
 
249 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>