More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2835 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2835  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2234  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  64.44 
 
 
225 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.364169  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2208  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  57.59 
 
 
224 aa  262  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.128407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2769  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  63.6 
 
 
227 aa  248  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  54 
 
 
218 aa  228  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50 
 
 
206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1845  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.24 
 
 
206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0151726  normal  0.945395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.01 
 
 
203 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22100  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.97 
 
 
205 aa  211  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2448  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  55.32 
 
 
222 aa  210  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.75 
 
 
206 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0253  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  51.33 
 
 
229 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.5 
 
 
206 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1254  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.88 
 
 
225 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2703  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.66 
 
 
225 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00267955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2609  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  53.4 
 
 
225 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.49 
 
 
204 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0733  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  50.51 
 
 
211 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.54904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1816  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.96 
 
 
204 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0209797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2107  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.45 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000116567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2513  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.79 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114714 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0726  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.04 
 
 
206 aa  195  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.303566  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.24 
 
 
220 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.59 
 
 
214 aa  191  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.48 
 
 
215 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.54 
 
 
213 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  48.5 
 
 
209 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2997  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.41 
 
 
214 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.386914  hitchhiker  0.000268593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2696  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
212 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
212 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2869  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
212 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1169  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.02 
 
 
212 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.72 
 
 
202 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.5 
 
 
212 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2874  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.02 
 
 
212 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.551814  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2760  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.02 
 
 
212 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21792  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2648  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.55 
 
 
212 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02392  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.55 
 
 
212 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1176  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.55 
 
 
212 aa  185  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.755635  normal  0.0529189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.55 
 
 
212 aa  185  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.154299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2989  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.24 
 
 
213 aa  185  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1776  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.05 
 
 
213 aa  185  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000344484  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02354  hypothetical protein  44.55 
 
 
212 aa  185  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.110228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3723  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.02 
 
 
212 aa  185  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.160201  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2635  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.55 
 
 
212 aa  185  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.47 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04220  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, formyltetrahydrofolate-dependent  46.04 
 
 
212 aa  182  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02149  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.33 
 
 
216 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.9 
 
 
205 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1350  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.29 
 
 
212 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1233  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.29 
 
 
212 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.37 
 
 
217 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52050  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.56 
 
 
222 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3119  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.29 
 
 
212 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.32 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1477  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.41 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.04 
 
 
209 aa  178  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0532  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  49.74 
 
 
202 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00415647  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1699  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.88 
 
 
216 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3690  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.66 
 
 
216 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.864702  decreased coverage  0.000250374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.98 
 
 
213 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.59 
 
 
216 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2809  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.15 
 
 
217 aa  175  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
222 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36900  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.81 
 
 
215 aa  175  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1063  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.19 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0515  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.19 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.549179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3525  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.29 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0302516  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2168  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  47.4 
 
 
224 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
214 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.259794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1664  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.84 
 
 
217 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278539  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.84 
 
 
217 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4054  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  46.84 
 
 
217 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01770  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.5 
 
 
201 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3157  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.22 
 
 
217 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409852  normal  0.0214096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.74 
 
 
220 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4216  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.45 
 
 
217 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.298326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1181  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
210 aa  168  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.29 
 
 
221 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1222  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.67 
 
 
217 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0923837  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1976  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.43 
 
 
208 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.899422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.39 
 
 
202 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.21 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04960  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.28 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1068  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.31 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2023  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.93 
 
 
219 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3012  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.5 
 
 
205 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.83 
 
 
223 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2490  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.05 
 
 
218 aa  165  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.66 
 
 
209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.779009  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0893  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  40.87 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000873186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1088  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.24 
 
 
187 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2993  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.54 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0576  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.72 
 
 
221 aa  164  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2638  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.93 
 
 
209 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0230258  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1129  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.15 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.462935 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  43.58 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.71 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1102  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.68 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  41.58 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>