47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2807 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  54.87 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  46.3 
 
 		 146 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  40.91 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  39.66 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  46.75 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  34 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  37.25 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  34.45 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0580  nuclease (SNase-like)  28.37 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  33.96 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  33.94 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 		 193 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0029  nuclease (SNase-like)  33.65 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.139234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  32.35 
 
 		 284 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  32.43 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.04 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  33.66 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  29.65 
 
 		 334 aa  48.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  33.91 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  31.07 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  31.07 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.87 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  36.89 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  37.74 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  27.54 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  33.64 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  27.54 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  29.41 
 
 		 260 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  29.52 
 
 		 333 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  32.84 
 
 		 259 aa  45.1  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.77 
 
 		 286 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  32.52 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  28.49 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  35.35 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  33.33 
 
 		 327 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  32.71 
 
 		 263 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.48 
 
 		 227 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  28.3 
 
 		 350 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  32.71 
 
 		 169 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  26.25 
 
 		 228 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.97 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  28.45 
 
 		 271 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  31.07 
 
 		 408 aa  40.8  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>