More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2741 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  48.91 
 
 
697 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  66.76 
 
 
686 aa  994    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  64.71 
 
 
685 aa  944    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  48.68 
 
 
697 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  70.99 
 
 
687 aa  1014    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  47.88 
 
 
692 aa  675    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  76.43 
 
 
688 aa  1106    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  47.95 
 
 
697 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  100 
 
 
686 aa  1408    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  50.59 
 
 
701 aa  699    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  48.91 
 
 
694 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  50.59 
 
 
701 aa  680    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  48.63 
 
 
691 aa  675    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  50 
 
 
694 aa  695    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2103  elongation factor G  73.32 
 
 
688 aa  1055    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  50.58 
 
 
691 aa  726    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  45.23 
 
 
690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  43.92 
 
 
670 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.51 
 
 
692 aa  589  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  44.18 
 
 
679 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  44 
 
 
696 aa  587  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  41.81 
 
 
695 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  42.48 
 
 
696 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  41.82 
 
 
695 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  43.81 
 
 
692 aa  575  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  44.3 
 
 
701 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  43.21 
 
 
692 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  44.04 
 
 
680 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.94 
 
 
682 aa  565  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  40.73 
 
 
696 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  40.44 
 
 
696 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  43.13 
 
 
692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  40.78 
 
 
697 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  40.35 
 
 
697 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  41.33 
 
 
694 aa  559  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  40.49 
 
 
697 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  41.37 
 
 
692 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  41.25 
 
 
692 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  40.82 
 
 
673 aa  554  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  41.43 
 
 
697 aa  554  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  40.82 
 
 
691 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  41.45 
 
 
692 aa  549  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  41.2 
 
 
688 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  40.64 
 
 
692 aa  551  1e-155  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  41.02 
 
 
692 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  42.21 
 
 
688 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  42.07 
 
 
688 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  42.11 
 
 
667 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  41.64 
 
 
689 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  40.67 
 
 
692 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  40.62 
 
 
689 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  40.92 
 
 
673 aa  542  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  39.62 
 
 
697 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.2 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  40 
 
 
692 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  40.95 
 
 
682 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  39.85 
 
 
692 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  40.29 
 
 
699 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  40.03 
 
 
692 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  39.88 
 
 
692 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  39.88 
 
 
692 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  40.03 
 
 
692 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  40.03 
 
 
692 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  39.88 
 
 
692 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  40.46 
 
 
692 aa  537  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  39.88 
 
 
692 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  40.29 
 
 
699 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  40.78 
 
 
698 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  40.23 
 
 
697 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  42.44 
 
 
697 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  39.74 
 
 
692 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  41.88 
 
 
692 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  41.25 
 
 
697 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  39.5 
 
 
692 aa  533  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  39.74 
 
 
692 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  38.99 
 
 
696 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  40.5 
 
 
689 aa  535  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  39.36 
 
 
692 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  38.98 
 
 
693 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  41.31 
 
 
707 aa  535  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  40.29 
 
 
691 aa  529  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  39.77 
 
 
691 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  40.29 
 
 
691 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  39.82 
 
 
692 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.55 
 
 
697 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  39.36 
 
 
691 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  39.94 
 
 
698 aa  525  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  40.46 
 
 
694 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  40.46 
 
 
694 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  40.61 
 
 
700 aa  527  1e-148  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  39.74 
 
 
697 aa  528  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  40.35 
 
 
698 aa  528  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  38.7 
 
 
693 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  40.9 
 
 
694 aa  522  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  39.6 
 
 
697 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  38.73 
 
 
695 aa  525  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  39.77 
 
 
698 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  40.29 
 
 
700 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  40.52 
 
 
699 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  40.29 
 
 
700 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>