More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2689 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
379 aa  766    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  68.87 
 
 
395 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  67.11 
 
 
380 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  59.95 
 
 
384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  58.62 
 
 
378 aa  428  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2247  gamma-glutamyl kinase  57.14 
 
 
436 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.353036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  47.98 
 
 
373 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  48.25 
 
 
373 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  43.05 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  44.5 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.28 
 
 
376 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.37 
 
 
377 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  44.02 
 
 
378 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  44.78 
 
 
383 aa  290  3e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
371 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  44.47 
 
 
373 aa  289  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
374 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  44.84 
 
 
372 aa  285  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  41.67 
 
 
376 aa  285  9e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  40.61 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  41.94 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  43.7 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  42.35 
 
 
373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  42.62 
 
 
373 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  45.14 
 
 
374 aa  282  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
367 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  44.99 
 
 
372 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  42.54 
 
 
393 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  41.8 
 
 
373 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
374 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  44.39 
 
 
373 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  43.82 
 
 
374 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  0.00000138199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  42.01 
 
 
376 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  42.01 
 
 
376 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  42.86 
 
 
372 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  44.12 
 
 
378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  41.33 
 
 
375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  43.09 
 
 
372 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  43.4 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 
372 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
372 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
372 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  43.43 
 
 
372 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0068  gamma-glutamyl kinase  40.43 
 
 
368 aa  269  8e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  43.55 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.75 
 
 
368 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  41.51 
 
 
376 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  42.43 
 
 
378 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  42.02 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
373 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  43.92 
 
 
375 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  37.3 
 
 
373 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  44.05 
 
 
373 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  43.36 
 
 
375 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  44.66 
 
 
372 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  38.04 
 
 
371 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  41.89 
 
 
378 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  38.92 
 
 
373 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0554  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
372 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00395721  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0512  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3010  gamma-glutamyl kinase  40.53 
 
 
393 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  39.45 
 
 
373 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  42.01 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
374 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3914  gamma-glutamyl kinase  42.67 
 
 
380 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  41.05 
 
 
367 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  42.55 
 
 
372 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  40 
 
 
387 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
374 aa  258  9e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3064  gamma-glutamyl kinase  43.99 
 
 
374 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.371961  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  41.69 
 
 
389 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  42.51 
 
 
389 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 
372 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 
394 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3515  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 
374 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  41.46 
 
 
372 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3823  gamma-glutamyl kinase  41.3 
 
 
370 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  41.98 
 
 
376 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4216  gamma-glutamyl kinase  42.12 
 
 
373 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  normal  0.0334749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  41.76 
 
 
376 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0430  glutamate 5-kinase  41.22 
 
 
385 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>