More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2643 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 168 aa  345  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  39.02 
 
 		 515 aa  117  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  37.13 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30.54 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.53 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.76 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  31.36 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.89 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.22 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.91 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.67 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  36.81 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.52 
 
 		 208 aa  67.4  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.95 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  33.54 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  33.54 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  33.75 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.95 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.29 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  34.19 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.12 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.06 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.74 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.32 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.64 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.14 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.67 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.9 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.9 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  28.48 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  31.76 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.15 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.16 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  32.28 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.86 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.33 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  27.06 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  32.14 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  32.93 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  29.65 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.29 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.74 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  32.3 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 278 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.94 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.98 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  33.54 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  30.19 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.31 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.13 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  29.76 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2112  UspA domain protein  27.65 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  32.32 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.12 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.54 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  27.43 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  33.13 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  32.3 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2106  UspA domain protein  26.19 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.56 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  29.88 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  29.88 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.29 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  30.67 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  29.3 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  28.83 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.43 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.75 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.78 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  29.45 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  30.86 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  50.77 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.13 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  33.12 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  31.52 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.75 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  29.94 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  30.36 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  29.56 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  33.75 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  28.57 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  30.52 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  32.92 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  32.74 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>