More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2608 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  84.62 
 
 		 130 aa  228  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  81.54 
 
 		 130 aa  221  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 		 130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 		 130 aa  196  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  66.92 
 
 		 130 aa  190  7e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  62.1 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 130 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  62.31 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  62.1 
 
 		 130 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 128 aa  157  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3451  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0078135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  58.78 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  58.78 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  56.92 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3766  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0197  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 133 aa  150  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3353  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507288  hitchhiker  0.0000404008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0608  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451686  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2563  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0491  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0372353  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4112  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>