More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2523 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  40.87 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  39.23 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.48 
 
 
217 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  38.21 
 
 
214 aa  138  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
396 aa  134  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0471  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.13 
 
 
210 aa  125  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  35.94 
 
 
219 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  36.49 
 
 
219 aa  121  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
220 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  35.61 
 
 
456 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.36 
 
 
223 aa  118  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  35.61 
 
 
456 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  31.1 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 
213 aa  115  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.69 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  38.6 
 
 
225 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  38.6 
 
 
225 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  34.43 
 
 
456 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.08 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
235 aa  109  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
222 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.83 
 
 
217 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.67 
 
 
218 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  33.52 
 
 
188 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  37.5 
 
 
195 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  33.64 
 
 
219 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  33.49 
 
 
216 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  42.79 
 
 
226 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  35.98 
 
 
221 aa  104  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  32.97 
 
 
188 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  34.62 
 
 
218 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.19 
 
 
233 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  38.59 
 
 
263 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  32.37 
 
 
207 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.86 
 
 
224 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  34.59 
 
 
188 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
227 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.92 
 
 
223 aa  101  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.9 
 
 
227 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  34.05 
 
 
188 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  32.42 
 
 
188 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  31.98 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  28.7 
 
 
222 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  31.08 
 
 
221 aa  99  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.78 
 
 
219 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  32.87 
 
 
242 aa  99  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 
249 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  31.05 
 
 
216 aa  99  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.52 
 
 
234 aa  98.2  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.82 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  27.83 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.17 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  28.44 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  28.09 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.23 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.86 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  31.8 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  31.31 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.39 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  33.7 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  34.24 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  37.63 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  38.83 
 
 
230 aa  95.5  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  34.24 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  34.24 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  34.24 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28.31 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.98 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  33.16 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.33 
 
 
244 aa  95.5  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.61 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  34.82 
 
 
218 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  30.98 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.24 
 
 
188 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  32.43 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
223 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  30.66 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  32.43 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  34.92 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  32.43 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  33.7 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.89 
 
 
227 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 
188 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.92 
 
 
215 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  34.41 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  33.7 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  33.7 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3766  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
229 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0631414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.51 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  30 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  32.07 
 
 
269 aa  92.8  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>