More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2522 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2522  putative fructokinase  100 
 
 
300 aa  597  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000987488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1054  ribokinase family sugar kinase  44.37 
 
 
300 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553217  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  39.45 
 
 
292 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0367  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 
296 aa  201  8e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000567214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4230  PfkB domain protein  40.82 
 
 
302 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.98 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2609  PfkB  39.79 
 
 
311 aa  168  9e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  34.56 
 
 
300 aa  162  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2911  PfkB domain protein  38.93 
 
 
320 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1998  PfkB domain protein  36.3 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 
303 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  33.1 
 
 
306 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  35.19 
 
 
305 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3183  PfkB domain protein  32.29 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208459  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  29.76 
 
 
301 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3273  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 
320 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.225179  normal  0.109197 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1796  PfkB  33.56 
 
 
293 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000052274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  37.33 
 
 
294 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  31.47 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  34.9 
 
 
308 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  30.77 
 
 
324 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2268  PfkB  35.56 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0018  PfkB domain protein  26.21 
 
 
300 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3070  PfkB family of carbohydrate kinase  33.67 
 
 
305 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1550  carbohydrate kinase, PfkB family  33 
 
 
303 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1266  PfkB domain protein  33 
 
 
303 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.341209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0033  PfkB domain protein  35.99 
 
 
294 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.49998  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  32.12 
 
 
304 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  32.12 
 
 
304 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  32.86 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 
323 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.35 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.87 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  31.23 
 
 
645 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.58 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  33.71 
 
 
328 aa  89  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 
329 aa  87.8  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.38 
 
 
298 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  28.99 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.34 
 
 
311 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.9 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  29.64 
 
 
645 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  28.66 
 
 
309 aa  85.9  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  29.89 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.57 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  29.25 
 
 
311 aa  82.4  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  28.99 
 
 
645 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27.67 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  29.79 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  27.97 
 
 
647 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.55 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  27.88 
 
 
647 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  29.87 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  27.18 
 
 
670 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  30.69 
 
 
317 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.61 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.89 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  30.15 
 
 
322 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  28.16 
 
 
681 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.85 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  28.24 
 
 
308 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  27.51 
 
 
633 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  34.29 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  27.3 
 
 
680 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  30.24 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  25.08 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  28.12 
 
 
634 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  27.42 
 
 
636 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  28.35 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 
635 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  27.83 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
642 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  28.52 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  30.96 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  28.39 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  26.44 
 
 
640 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  26.16 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  28.87 
 
 
659 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  25.35 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  27.09 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.25 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  29.47 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  28.53 
 
 
643 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  30.07 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.13 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  31.56 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.91 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  28.17 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.65 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.96 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>