272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2493 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  64.58 
 
 
809 aa  1047    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  47.3 
 
 
813 aa  720    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  69.03 
 
 
795 aa  1135    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  51.87 
 
 
815 aa  737    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  49.08 
 
 
925 aa  768    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  47.3 
 
 
813 aa  720    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  65.38 
 
 
788 aa  1043    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
799 aa  1644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  52.27 
 
 
785 aa  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  46.26 
 
 
796 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  86.38 
 
 
796 aa  1391    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  64.58 
 
 
809 aa  1047    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  66.2 
 
 
784 aa  1064    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  62.97 
 
 
768 aa  1014    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  45.09 
 
 
971 aa  698    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  62.98 
 
 
786 aa  1000    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  65.44 
 
 
794 aa  1056    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  42.19 
 
 
778 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  40.77 
 
 
998 aa  570  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  34.47 
 
 
920 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  68.28 
 
 
154 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  31.51 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  71.79 
 
 
195 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  31.08 
 
 
479 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  30.87 
 
 
479 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  31.22 
 
 
479 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  31.26 
 
 
479 aa  160  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.44 
 
 
485 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  30.73 
 
 
485 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  30.16 
 
 
463 aa  141  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  27.16 
 
 
560 aa  95.1  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  27.16 
 
 
560 aa  94.4  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  49.41 
 
 
279 aa  94.4  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  27.53 
 
 
473 aa  88.6  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  25.54 
 
 
560 aa  87.8  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 
560 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  25.54 
 
 
398 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  25.62 
 
 
560 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25.38 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  27.59 
 
 
979 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  27.82 
 
 
548 aa  85.5  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  34.81 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  29.17 
 
 
647 aa  85.5  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  26.44 
 
 
815 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  32.5 
 
 
444 aa  84  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.48 
 
 
531 aa  84  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  27.41 
 
 
462 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  23.89 
 
 
551 aa  83.2  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  27.73 
 
 
654 aa  83.2  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  23.97 
 
 
466 aa  82  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  25.62 
 
 
813 aa  82  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.42 
 
 
652 aa  82  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  28.65 
 
 
551 aa  81.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.92 
 
 
812 aa  81.3  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.85 
 
 
974 aa  80.9  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  27.93 
 
 
548 aa  80.5  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  25 
 
 
466 aa  80.9  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  29.37 
 
 
488 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  32.96 
 
 
451 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  24.62 
 
 
967 aa  80.5  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.66 
 
 
558 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  26.21 
 
 
581 aa  80.1  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  34.94 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0021  hypothetical protein  55.07 
 
 
105 aa  78.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  36.88 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  28.24 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  26.91 
 
 
585 aa  78.2  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.62 
 
 
1077 aa  77.4  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  31.55 
 
 
451 aa  76.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  32.4 
 
 
451 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  33.52 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  35.14 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.77 
 
 
1053 aa  76.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 
1058 aa  76.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 
1043 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  26.46 
 
 
549 aa  75.5  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  30.89 
 
 
509 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  31.61 
 
 
590 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1354  hypothetical protein  27.55 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.721853  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  31.43 
 
 
650 aa  75.1  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  26.99 
 
 
1017 aa  74.7  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  35.21 
 
 
509 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.83 
 
 
629 aa  74.3  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 
602 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  25.21 
 
 
583 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  27.07 
 
 
584 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  34.18 
 
 
531 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  25.61 
 
 
967 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  33.55 
 
 
449 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  33.85 
 
 
993 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  33.81 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25.89 
 
 
590 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  26.8 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  35 
 
 
517 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.76 
 
 
550 aa  72  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 
558 aa  72  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 
584 aa  72  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  34.19 
 
 
444 aa  72  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  25 
 
 
574 aa  72  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>