97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2484 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  915    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1187  hypothetical protein  55.42 
 
 
418 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000236385  decreased coverage  0.000174597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3051  protein of unknown function DUF88  56.94 
 
 
418 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0587  protein of unknown function DUF88  70.41 
 
 
240 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000787089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  34.17 
 
 
448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3848  hypothetical protein  33.26 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0344  protein of unknown function DUF88  40.59 
 
 
504 aa  206  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.752457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1706  hypothetical protein  40 
 
 
507 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.936741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3564  hypothetical protein  32.12 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0028  protein of unknown function DUF88  39.57 
 
 
509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1289  protein of unknown function DUF88  50 
 
 
474 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0260555  hitchhiker  0.00441203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4578  protein of unknown function DUF88  39.92 
 
 
527 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.975373  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0546  protein of unknown function DUF88  28.18 
 
 
426 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.2 
 
 
249 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  27.84 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  32.64 
 
 
501 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  32.64 
 
 
507 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  28.4 
 
 
253 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  27.45 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  31.94 
 
 
564 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  32.65 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  32.65 
 
 
498 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  32.65 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  32.65 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  31.29 
 
 
508 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  32.54 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  31.94 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  31.94 
 
 
483 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  30.67 
 
 
480 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  31.94 
 
 
472 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  33.33 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  30.67 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  31.91 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  31.25 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  31.94 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  28.87 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  30.61 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  34.19 
 
 
246 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  34.84 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  34.84 
 
 
248 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  32.8 
 
 
251 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  28.17 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  23.72 
 
 
787 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  24.64 
 
 
842 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  36.36 
 
 
239 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  23.72 
 
 
600 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  31.58 
 
 
260 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  49.09 
 
 
236 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  24.05 
 
 
789 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  28.21 
 
 
273 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  42.19 
 
 
262 aa  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  52.17 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  27.88 
 
 
246 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  29.07 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  52.17 
 
 
263 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  41.67 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  27.95 
 
 
247 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  33.68 
 
 
267 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  24.56 
 
 
450 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  27.27 
 
 
432 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  32.14 
 
 
432 aa  47  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  27.61 
 
 
249 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  35.85 
 
 
470 aa  47  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  31.03 
 
 
275 aa  46.6  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  20.86 
 
 
272 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  25.27 
 
 
296 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  46.94 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  22.94 
 
 
268 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  48.84 
 
 
259 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0489  protein of unknown function DUF88  46.15 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  27.54 
 
 
279 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  30.23 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1440  hypothetical protein  35 
 
 
192 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  38.46 
 
 
258 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  30.56 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0035  protein of unknown function DUF88  31.86 
 
 
219 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  33.85 
 
 
275 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49641  predicted protein  34.55 
 
 
779 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  48.94 
 
 
254 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  24.73 
 
 
335 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  47.83 
 
 
284 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  32 
 
 
246 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  29.51 
 
 
371 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  44.68 
 
 
252 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  47.83 
 
 
234 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  47.83 
 
 
234 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  44.68 
 
 
247 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2865  hypothetical protein  25.65 
 
 
206 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414585  normal  0.0571664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0433  protein of unknown function DUF88  36 
 
 
294 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  46.81 
 
 
272 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1144  protein of unknown function DUF88  36.08 
 
 
193 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  36.21 
 
 
334 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  35.16 
 
 
240 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>