228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2479 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 163 aa  320  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  69.94 
 
 		 163 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  67.48 
 
 		 163 aa  236  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  59.88 
 
 		 163 aa  207  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  61.11 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  53.99 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  55.56 
 
 		 161 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  57.06 
 
 		 161 aa  177  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  52.47 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  54.32 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  52.76 
 
 		 161 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  54.32 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  48.15 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  48.47 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  47.83 
 
 		 164 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  45.68 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  45.68 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  47.53 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  44.1 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  45.34 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  49.38 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  48.17 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4311  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 163 aa  130  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  44.38 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4497  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1728  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.499513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  43.83 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1098  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0754  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  45.12 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2254  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000945037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3208  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04099  nucleotide-binding protein  40.12 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  45.12 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1854  putative nucleotide-binding protein  44.17 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2893  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  45.12 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>