More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2474 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  89.47 
 
 		 95 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  87.37 
 
 		 95 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 95 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  74.74 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  69.47 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 95 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 96 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  65.59 
 
 		 98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  126  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  64.52 
 
 		 98 aa  126  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  64.21 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  123  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  123  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 105 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  121  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>