More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2343 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 431 aa  863    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  43.65 
 
 		 487 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  42.61 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  37.37 
 
 		 415 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  40.53 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  38.38 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  41.12 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  37.84 
 
 		 414 aa  256  8e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  33.08 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  33.99 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  31.83 
 
 		 406 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  32.75 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  32.51 
 
 		 407 aa  210  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  35.48 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  31.17 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  30.85 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  32.83 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  29.47 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  30.92 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  32.92 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  32.09 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  32.01 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  35.64 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  33.08 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  30.08 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  31.08 
 
 		 400 aa  196  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  30.37 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  29.95 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  32.58 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  31.08 
 
 		 408 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  29.95 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  27.79 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  34.01 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  29.93 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  29.35 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  30.45 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  26.82 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  31.44 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  31.66 
 
 		 413 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  28.25 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  29.29 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  30.79 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  28.71 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  29.93 
 
 		 405 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  28.96 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  27.62 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  33.16 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  30.47 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  27.79 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  29 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  29.24 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  29.24 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  31.86 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  31.73 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  25.38 
 
 		 400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  27.25 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  27.52 
 
 		 410 aa  151  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  28.25 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  29.53 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  29.35 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  28.05 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  28.05 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  26.48 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  28.68 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  26.67 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  28.78 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  34.62 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.3 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  29.56 
 
 		 444 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  25.06 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  25.76 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  25.65 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  36.36 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  30.07 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  29.87 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  27.35 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  23.06 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  22.22 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4213  EAL  28.03 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  30.52 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2226  diguanylate phosphodiesterase  32.56 
 
 		 242 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0863855  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2227  diguanylate phosphodiesterase  36.55 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.00585618 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  28.42 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  27.88 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.43 
 
 		 723 aa  72  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  24.41 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1771  diguanylate phosphodiesterase  26.61 
 
 		 763 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718103  normal  0.459979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0558  putative signal transduction protein  28.18 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>