More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2295 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 		 551 aa  776    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 551 aa  657    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 551 aa  664    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 551 aa  1134    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 550 aa  678    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  68.06 
 
 		 551 aa  781    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 554 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 587 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 554 aa  511  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 559 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 559 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 586 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 592 aa  490  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 584 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 586 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 589 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 589 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 570 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 550 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 585 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 563 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 598 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 568 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 561 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 588 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 562 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 556 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 556 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 556 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 556 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 605 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 556 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 551 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 556 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 598 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4245  arginyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 586 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 564 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 611 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 592 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 559 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 560 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1524  arginyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 597 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 575 aa  433  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3935  arginyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 576 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 597 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3022  arginyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 583 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0495  arginyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 598 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.500043 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 561 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1728  arginyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 581 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.231273  normal  0.529501 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 587 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3396  arginyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.111317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1807  arginyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 597 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.738277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 597 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 562 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 522 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3705  arginyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.893232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 546 aa  428  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2943  arginyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 583 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 561 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 609 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1813  arginyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 585 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1588  arginyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 580 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.175533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1158  arginyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 585 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 546 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2508  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 597 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0431095 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 556 aa  422  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3587  arginyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 594 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.919979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0902  arginyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.0464581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 553 aa  425  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02918  arginyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 562 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2710  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 590 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.568206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>